LncRNA在前列腺增生性炎性萎縮向前列腺癌惡性轉(zhuǎn)化過程中差異表達的初步研究.pdf

1、分類號： 密級： U D C：學(xué)號：416523212194 南 昌 大 學(xué) 碩 士 研 究 生 學(xué) 位 論 文 LncRNA 在前列腺增生性炎性萎縮向前列腺癌 前列腺增生性炎性萎縮向前列腺癌 惡性轉(zhuǎn)化 惡性轉(zhuǎn)化過程 過程中差異表達 差異表達的初步 初步研究 研究 Differentially Expression of Long non-coding RNA

2、s in the Malignant Transformation from Proliferative Inflammatory Atrophy to Prostate Carcinoma: An Preliminary Study 郝 超 培養(yǎng)單位（院、系） ：南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院 指導(dǎo)教師姓名、職稱：王共先 教授 申請學(xué)位的學(xué)科門類：醫(yī)學(xué) 學(xué)科專業(yè)名稱：外科學(xué)（泌尿外） 論文答辯日期：2015 年 6 月 答辯委員會主席：

3、 評閱人： 2015 年 6 月摘要 II 摘 要 目的： 目的： 利用微陣列基因芯片技術(shù)檢測前列腺癌（PCa） 、前列腺增生性炎性萎縮（PIA）和癌旁非癌組織中差異表達的 mRNA 和 lncRNA。觀察前列腺惡性轉(zhuǎn)化過程中基因表達的動態(tài)變化，進而發(fā)現(xiàn)可能存在的前列腺非可控性炎癥至惡性癌變過程中的特征分子網(wǎng)絡(luò)，為 PIA→PCa 發(fā)病模式提供分子層面的新證據(jù)，以期為臨床前

4、列腺癌的預(yù)防、診療，以及發(fā)病機制提供新理論及新方案。 方法： 方法： 收集 2013 年 8 月至 2014 年 8 月我院前列腺切除術(shù)后臨床組織標(biāo)本共 20 例，通過改進標(biāo)本獲取方式，運輸途徑，破碎方法三方面因素，建立從離體組織標(biāo)本提取高質(zhì)量總 RNA 的方法。隨后在此方法基礎(chǔ)上，通過冰凍切片結(jié)合手工顯微切割技術(shù)在同一前列腺組織標(biāo)本中分離出 PCa、 PIA 及癌旁非癌組織各區(qū)域的純凈細胞群。采用 lncRNA+mRNA 表達譜芯片

5、分析三者間的基因表達差異（生物學(xué)重復(fù) 3 次） ，通過生物信息學(xué)的方法篩選出具有顯著表達差異的 mRNA 和lncRNA，并對結(jié)果進行 Pathway 分析等初步的生物信息學(xué)分析，反向 Cis-預(yù)測lncRNA 的靶基因， 在發(fā)生顯著變化的炎癥和/或癌癥通路上建立 lncRNA 與靶基因的基因網(wǎng)絡(luò)圖。 結(jié)果： 結(jié)果： 1. 前列腺癌根治術(shù)后獲取的離體組織標(biāo)本，在 30min 內(nèi)放入液氮凍存，經(jīng)液氮研磨或冰凍切片均可以提取到高質(zhì)量的總 R

6、NA（RIN>7.5） 。 2. 手工顯微切割獲取的組織，可通過 Trizol 法提取到滿足高通量微陣列技術(shù)要求的高質(zhì)量 RNA，但 H&E 染色會降低 RNA 的完整性。 3. 基因表達譜芯片的結(jié)果顯示： 人前列腺癌組織與癌旁非癌組織對照相比，有 2610 個 mRNA 表達有差異，其中上調(diào) 689 個，下調(diào) 1921 個；同時有 2176個 lncRNA 表達有差異，其中上調(diào) 688 個，下調(diào) 1488 個。人前列腺增