水稻生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建.pdf

1、高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)與多抗水稻新品種的選育和推廣是實(shí)現(xiàn)我國(guó)糧食安全的重要途徑。目前水稻育種工作多數(shù)情況下仍然是建立在表型選擇和育種家的經(jīng)驗(yàn)之上，育種效率不高，為了讓育種工作者分享水稻分子生物學(xué)帶來(lái)的有效信息，筆者開(kāi)發(fā)了基于Ontology的數(shù)據(jù)整合技術(shù)，并構(gòu)建了水稻生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)。 以水稻數(shù)據(jù)資料檢索為核心，水稻生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)整合了與育種相關(guān)的各類(lèi)生物數(shù)據(jù)，實(shí)現(xiàn)了水稻綜合信息資源的共享。內(nèi)容上，該平臺(tái)建立了一個(gè)關(guān)系型數(shù)據(jù)庫(kù)集群，主要包括水

2、稻分子標(biāo)記數(shù)據(jù)庫(kù)、水稻基因(含QTL)數(shù)據(jù)庫(kù)、遺傳圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)、品種(含優(yōu)異種質(zhì))數(shù)據(jù)庫(kù)、參考文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)和Ontology系統(tǒng)，并以此為基礎(chǔ)，借助Microsoft的VML程序做了些數(shù)據(jù)庫(kù)的二次開(kāi)發(fā)和應(yīng)用，如構(gòu)建水稻品種DNA指紋鑒定數(shù)據(jù)庫(kù)和進(jìn)行水稻QTL圖譜整合研究等；技術(shù)上，本數(shù)據(jù)庫(kù)采用流行的ASP.net技術(shù)設(shè)計(jì)，SQL SERVER2005為底層數(shù)據(jù)庫(kù)，VB.net為程序語(yǔ)言。 水稻生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建，建立了生物數(shù)據(jù)和育種