不同鹽湖、鹽田之間嗜鹽古菌多樣性比較.pdf

鹽湖、鹽場(chǎng)以及土壤中蘊(yùn)藏著豐富的嗜鹽微生物資源，嗜鹽古菌目前具有重要的研究?jī)r(jià)值，本文對(duì)陜西定邊茍池、花馬池以及連云港鹽田三個(gè)鹽環(huán)境中嗜鹽古菌多樣性進(jìn)行了研究。采用分離培養(yǎng)技術(shù)分別從三個(gè)地區(qū)分離純化得到16個(gè)嗜鹽古菌菌株，通過(guò)PCR擴(kuò)增菌株的16S rDNA基因進(jìn)行測(cè)序分析，具體結(jié)果為從茍池分離純化得到的4株嗜鹽古菌，屬于鹽紅菌屬(Halorubrum)；從花馬池分離得到的2株分別屬于鹽盒菌屬(Haloarcula)和鹽紅菌屬(Halorubrum)；從連云港分離純化得到的10株菌，1株屬于鹽盒菌屬(Haloarcula)，9株為鹽紅菌屬(Halorubrum)。三個(gè)地區(qū)所有分離得到的菌株中，鹽紅菌屬（Halorubrum）為優(yōu)勢(shì)菌屬，占比87.5％。鹽盒菌屬（Haloarcula）在連云港鹽場(chǎng)和花馬池樣品中占比在12.5%左右。表明三個(gè)地區(qū)嗜鹽古菌的種群分布既具有相似性和又有各自的獨(dú)特性,這可能與環(huán)境溫度、鹽含量、酸堿性等有關(guān)。16S rDNA基因序列系統(tǒng)發(fā)育分析僅僅是測(cè)定微生物物種資源多樣性的一個(gè)分類(lèi)方法，如果想獲得更詳細(xì)、精確的分類(lèi)信息，還需要進(jìn)一步的分類(lèi)研究。
　　采用非培養(yǎng)技術(shù)進(jìn)一步對(duì)連云港地區(qū)鹽水環(huán)境嗜鹽古菌多樣性進(jìn)行研究。高通量測(cè)序結(jié)果表明，從環(huán)境樣品中總共獲得6126條有效序列，經(jīng)過(guò)去雜優(yōu)化最終獲得4895條序列用于后續(xù)的生物信息學(xué)分析。古菌的序列平均長(zhǎng)度488bp，古菌文庫(kù)中有535個(gè) OTUs。當(dāng)遺傳距離為0.03時(shí)，古菌的Chao1物種總數(shù)、ACE指數(shù)、Shannon多樣性指數(shù)分別為764、834、4.76；樣品中古菌均屬于鹽桿菌科(Halobacteriacea)，共分為14個(gè)屬：鹽紅菌屬(Halorubrum)53.56%、鹽微菌屬(Halomicrobium)0.17%、鹽盒菌屬(Haloarcula)2.32%、鹽盤(pán)菌屬(Haloplanus)5.32%、鹽棍菌屬(Halorhabdus)0.54%、鹽堿單胞菌屬(Natronomonas)1.1%、Halonotius22.22%、Halogranum0.03%、Natronoarchaeum0.11%、Halolamina0.17%、Halobellus4.86%以及未分類(lèi)的鹽桿菌屬1.79%，其中鹽紅菌屬(Halorubrum)和Halonotius為優(yōu)勢(shì)菌屬。
　　通過(guò)傳統(tǒng)的16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育分析，發(fā)現(xiàn)所測(cè)的連云港灌西鹽田樣品中優(yōu)勢(shì)菌屬為Halorubrum和Haloarcula，而高通量測(cè)序結(jié)果表明Halorubrum、Halonotius為優(yōu)勢(shì)菌屬。同時(shí)還有Halogranum、Natronoarchaeum、Haloarcula以及一些尚未分類(lèi)的菌屬存在。這說(shuō)明高通量測(cè)序?qū)τ诃h(huán)境微生物的分類(lèi)鑒定更為詳細(xì)，分類(lèi)結(jié)果更準(zhǔn)確。