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文檔簡介
1、金屬的凝固過程是一個非常復雜的過程,既包含宏觀過程也包含微觀過程。分子動力學可以從微觀尺度對液態(tài)金屬凝固的過程進行模擬。在分子動力學模擬中,模擬體系包含的粒子數(shù)越多,得到的數(shù)據(jù)就越精確,就越能精確地得到液態(tài)金屬凝固過程中的微觀性質(zhì),預測事物發(fā)展的趨勢,對具體的生產(chǎn)實踐提供指導。但是分子動力學串行程序運行速度慢,模擬的原子數(shù)目有限,使模擬得到的結果與真實情況差距較大。并行計算的興起,為大規(guī)模的分子動力學并行化提供了條件,促進了分子動力學并
2、行化的快速發(fā)展。
本文對分子動力學和并行計算基本理論進行了簡單的回顧,根據(jù)并行計算的基本理論與方法,把之前用于模擬液態(tài)金屬凝固的分子動力學并行程序改成基于MPI+OpenMP計算模型的并行程序,論文的核心工作包括以下內(nèi)容:
首先,針對以前的PVM并行程序只能模擬50,000-100,000個原子和計算效率低的問題,根據(jù)天河超級計算機的特點,結合分子動力學與并行計算基礎,設計基于MPI+OpenMP模型的分子動
3、力學并行算法,其中節(jié)點之間用MPI實現(xiàn)并行,節(jié)點內(nèi)采用OpenMP實現(xiàn)并行。
其次,我們用FORTRAN語言實現(xiàn)了該并行算法,與之前的并行程序進行了對比,并分析了此程序的性能。結果表明,該算法具有良好的加速比、并行效率和可擴展性,能夠模擬500,000-10,000,000個原子,使模擬規(guī)模擴大100倍。
最后,我們用該并行程序?qū)?,000,000個Al原子進行了數(shù)值模擬分析,實驗結果表明,模擬結果與真實結果
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