虛擬掩模光脫保護(hù)法制備高密度肽核酸芯片.pdf

1、肽核酸(PNA)是以中性酰胺鍵為骨架的一種DNA類似物。用PNA分子做基因芯片的探針，有望解決基因芯片應(yīng)用在分子生物學(xué)和生物醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域中存在的探針特異性與靈敏度之間的矛盾等問題。本文合成了PNA單體，并制備出高密度的PNA芯片，主要工作如下:
　　 對PNA芯片合成的虛擬掩模光刻系統(tǒng)進(jìn)行了介紹，同時給出了實(shí)驗(yàn)平臺中基于熒光試劑染色的曝光聚焦平面調(diào)節(jié)方法;
　　 改進(jìn)現(xiàn)存的超序列算法，提出翻轉(zhuǎn)算法，并通過實(shí)驗(yàn)證明該算法能有

2、效減少芯片原位合成制備循環(huán)次數(shù);分析曝光過程中的衍射負(fù)效應(yīng)，提出一種“拉伸”數(shù)學(xué)模型，降低由于光衍射引起的芯片合成中的堿基插入風(fēng)險;在此基礎(chǔ)上，開發(fā)了一套掩模圖生成軟件，可以輸出制備PNA芯片所需的虛擬掩模圖;
　　 設(shè)計(jì)合成2-(2-硝基苯)丙氧羰基(NPPOC)基團(tuán)作為光敏保護(hù)基團(tuán)，堿敏性的?；鶠閴A基環(huán)外氨基的保護(hù)基團(tuán)的PNA單體，并通過質(zhì)譜和核磁共振波譜對所得化合物的結(jié)構(gòu)進(jìn)行表征;
　　 依照光脫保護(hù)法制備PNA芯