基因數(shù)據(jù)倉庫及其應(yīng)用研究.pdf

1、本文的目標(biāo)是研究生物信息數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)，并在此基礎(chǔ)上建立一個(gè)統(tǒng)一的基因數(shù)據(jù)倉庫平臺(tái)，主要的工作包括：　　1.在分析當(dāng)前生物數(shù)據(jù)庫特點(diǎn)的基礎(chǔ)上提出了使用生物信息數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)來集成生物信息數(shù)據(jù)庫的模型。討論了生物信息數(shù)據(jù)倉庫的特點(diǎn)、系統(tǒng)結(jié)構(gòu)、主題選取、數(shù)據(jù)組織等諸多問題。這不是對(duì)數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)的簡(jiǎn)單應(yīng)用，而是結(jié)合生物數(shù)據(jù)和生物研究的特點(diǎn)，提出了和一般數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)不一樣的生物信息數(shù)據(jù)倉庫的構(gòu)建原則和思路?！　?.研究了生物信息數(shù)據(jù)倉庫中源數(shù)據(jù)

2、的抽取轉(zhuǎn)換和知識(shí)的動(dòng)態(tài)獲取問題。分析了源數(shù)據(jù)的常用格式，設(shè)計(jì)了相應(yīng)的源數(shù)據(jù)抽取轉(zhuǎn)換算法，并實(shí)現(xiàn)該算法為一個(gè)數(shù)據(jù)抽取-轉(zhuǎn)換模塊；討論了生物信息數(shù)據(jù)倉庫中的動(dòng)態(tài)知識(shí)獲取問題，給出了一個(gè)較好的分配、集成策略，并動(dòng)態(tài)地從本地或者外部數(shù)據(jù)源獲取知識(shí)。　　3.考慮到生物學(xué)家的普遍需求，本文利用上述生物信息數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)和兩個(gè)工具模塊，構(gòu)建了一個(gè)基于疾病的基因數(shù)據(jù)倉庫BioWorld，BioWorld從多個(gè)不同的生物信息數(shù)據(jù)庫中集成了包括基因、蛋白質(zhì)