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1、隨著當(dāng)代社會(huì)信息快速發(fā)展,每日在氣象預(yù)報(bào)、計(jì)算生物學(xué)、商業(yè)風(fēng)險(xiǎn)計(jì)算、科學(xué)研究等領(lǐng)域產(chǎn)生海量的信息?;趚86體系結(jié)構(gòu)的處理器由于元件的縮小和散熱等工藝技術(shù)的限制,很難再有大的性能飛躍。為了應(yīng)對(duì)海量數(shù)據(jù)問題,使用GPU來加速計(jì)算己成為一種趨勢(shì)。
在研究病毒中,為跟蹤單點(diǎn)病毒粒子,會(huì)拍攝下大量的粒子圖像。這些粒子的熒光圖像在超顯微鏡下的亮度值呈點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù)形式。粒子的特征可以通過曲線擬合來得到。Levnberg-Marquard
2、t算法是擬合曲線的一種穩(wěn)定而快速的擬合方法。當(dāng)擬合拍攝下的大量囊泡粒子圖像時(shí),這將是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。
結(jié)合當(dāng)前的GPU技術(shù)和擬合大量的粒子圖像,本文基于CPU+GPU異構(gòu)架構(gòu)上做了如下貢獻(xiàn)和工作:
1,設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了基于CPU+GPU架構(gòu)的適用完整高斯函數(shù)、無角度高斯函數(shù)、圓形高斯函數(shù)等三種情形的GPU-GauseFitting并行程序。通過大量實(shí)驗(yàn)證明在擬合圖像幀數(shù)大于1000的情況下,該GPU程序能夠獲得相
3、對(duì)于串行程序CPU-GauseFitting40倍以上的加速比。
2,為了應(yīng)對(duì)在拍攝中拍攝到兩個(gè)囊泡的情況,對(duì)GPU-Gause Fitting進(jìn)行可擴(kuò)展性重構(gòu)。擴(kuò)展后的GPU-GauseFitting2程序更加具有普適性。通過大量實(shí)驗(yàn)證明在擬合圖像幀數(shù)大于1000的情況下,該GPU程序能夠獲得相對(duì)于串行程序CPU-GauseFitting60倍以上的加速比。
3,設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了基于CPU+GPU架構(gòu)的并行樸素
4、貝葉斯分類器(GPU-NBC)。使用該程序?qū)M合圖像的結(jié)果數(shù)據(jù)進(jìn)行分類,實(shí)驗(yàn)證明在數(shù)據(jù)量大于1000的情況下,結(jié)果顯示能夠獲得相對(duì)于CPU-NBC20倍左右的加速比。此外還使用本程序?qū)碜訳CI的10個(gè)以上的數(shù)據(jù)進(jìn)行與CPU-NBC程序進(jìn)行對(duì)比試驗(yàn),獲得了2~50倍的加速比。
本文基于CPU+GPU異構(gòu)架構(gòu)實(shí)現(xiàn)的GPU-GauseFitting方法,能夠快速的對(duì)圖像數(shù)據(jù)進(jìn)行擬合。同時(shí)GPU-NBC在數(shù)據(jù)分類中也能很好的起到
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