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1、在單核苷酸多態(tài)性研究中,涉及到對(duì)大量核酸樣本的處理和分析,需要我們提供一種能夠?qū)崿F(xiàn)高通量、自動(dòng)化的檢測(cè)平臺(tái)。為此,本課題組構(gòu)建了一種集成樣本處理、核酸擴(kuò)增、熒光檢測(cè)與分析的自動(dòng)化核酸檢測(cè)工作站。本文主要是設(shè)計(jì)與之配套的軟件操作系統(tǒng),通過豐富的界面功能設(shè)計(jì)對(duì)硬件平臺(tái)的資源進(jìn)行統(tǒng)一的管理和控制,尤其是提供友好的可編程界面使用戶獲得實(shí)驗(yàn)流程的全自動(dòng)化操作,實(shí)現(xiàn)核酸檢測(cè)的一站式服務(wù)。
本軟件嚴(yán)格按照軟件開發(fā)流程,首先確定用戶需求分析,
2、然后對(duì)系統(tǒng)的模塊劃分、功能分配、接口、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)等進(jìn)行總體設(shè)計(jì),描述實(shí)現(xiàn)具體模塊所涉及到的主要算法、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、類的層次結(jié)構(gòu)及調(diào)用關(guān)系,最終利用C#語言進(jìn)行程序編碼和軟件測(cè)試。計(jì)算機(jī)與硬件平臺(tái)之間定義統(tǒng)一的串口通信協(xié)議,設(shè)計(jì)面向研究人員的用戶指令,包含一對(duì)一移液、一對(duì)多移液、移板、振動(dòng)、擴(kuò)增、熒光檢測(cè)、延時(shí)和暫停等,用戶在軟件界面上選擇這些指令,經(jīng)過編譯器生成指令流,通過串口發(fā)送給硬件平臺(tái),硬件平臺(tái)依次取出指令隊(duì)列中的指令進(jìn)行響應(yīng)。為了滿足
3、不同的實(shí)驗(yàn)需求,設(shè)計(jì)了可編程的流程控制器,利用消息隊(duì)列和多線程控制完成大量事件的消息響應(yīng)和異常處理,實(shí)現(xiàn)在線編程的功能。
為了考察軟件設(shè)計(jì)的可行性和運(yùn)行的完美性,設(shè)計(jì)了移液精確度和準(zhǔn)確度驗(yàn)證實(shí)驗(yàn),一方面測(cè)試了軟件操作系統(tǒng),另一方面驗(yàn)證了本工作站的系統(tǒng)性能。該實(shí)驗(yàn)采用重力測(cè)量法,在20℃、48%RH的條件下,預(yù)濕吸頭,以蒸餾水為樣品,測(cè)定體積為200μ1、100μl和20μl時(shí)的精確度分別是0.17%、0.3%和0.58%,準(zhǔn)確
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