BH3 mimetics分子優(yōu)化的量熱學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、B-cell lymphoma2(Bcl-2)家族蛋白是細(xì)胞凋亡的主要調(diào)控者,它包括促凋亡蛋白和抗凋亡蛋白兩類,這兩種功能截然相反的蛋白通過共有的Bcl-2 homology domain3(BH3)進(jìn)行相互作用決定細(xì)胞的生與死。因此,許多研究組致力于靶向Bcl-2家族蛋白BH3溝槽的小分子抑制劑的研究,這些小分子抑制劑也稱為BH3 mimetics,目前還沒有BH3mimetics被批準(zhǔn)上市。處于臨床期的ABT-737由于不能拮抗my

2、eloid cell leukemiasequence1(Mcl-1)蛋白而對許多癌癥產(chǎn)生耐藥。因此,BH3 mimetics作為抗癌藥的研究依然面臨著很多挑戰(zhàn)。
  眾所周知,藥物分子與靶標(biāo)蛋白的結(jié)合過程必然涉及到熱量的變化。在熱力學(xué)水平,結(jié)合常數(shù)(Ka)、由吉布斯自由能(△G)、焓(△H)和熵(△S)是描述小分子與靶標(biāo)蛋白相互作用的參數(shù),等溫滴定量熱實(shí)驗(yàn)(isothermal titration calorimetry,ITC

3、)是唯一一種將結(jié)合能拆分成焓變和熵變,并且能測得上述所有參數(shù)的一種方法。焓變值可以證實(shí)氫鍵的形成,在分子優(yōu)化過程中實(shí)時(shí)監(jiān)測焓值、熵值的變化可以用于指導(dǎo)小分子抑制劑的優(yōu)化。因此,將量熱學(xué)手段運(yùn)用于小分子抑制劑的優(yōu)化不失為一種有效的方法。
  本文通過BH3 mimetics和Mcl-1蛋白的等溫滴定量熱實(shí)驗(yàn),分析其結(jié)合模式,并用于指導(dǎo)其他BH3 mimetics的優(yōu)化。
  首先,我們構(gòu)建了人源Mcl-1蛋白的重組質(zhì)粒,通過條

4、件的摸索與優(yōu)化獲得了純度為95%的Mcl-1蛋白。通過圓二色光譜分析證明純化所得蛋白的二級結(jié)構(gòu)以a螺旋為主,15N-1H異核化學(xué)位移相關(guān)譜(1H detected heteronuclear single quantum coherence,HSQC)表明蛋白質(zhì)各氨基酸的共振峰分散均勻,具有穩(wěn)定的、折疊良好的結(jié)構(gòu),熒光偏振實(shí)驗(yàn)證明Mcl-1蛋白的活性正常,這一系列結(jié)果證明純化所得蛋白滿足后續(xù)檢測的要求。
  接下來,我們對本課題組

5、合成的小分子8與Mcl-1蛋白進(jìn)行核磁滴定實(shí)驗(yàn)證實(shí)了化合物8結(jié)合在Mcl-1的BH3溝槽,然后用等溫滴定量熱的方法分別測得化合物8與Mcl-1和Mcl-1(R263A)作用的量熱學(xué)數(shù)據(jù),通過分析兩次焓值證實(shí)了化合物8與Mcl-1 BH3溝槽的R263形成了氫鍵。
  基于上述研究,我們又用等溫滴定量熱實(shí)驗(yàn)監(jiān)測一系列BH3 mimetics1-6與Mcl-1蛋白的作用,并對量熱學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行了測定與分析?;衔?與1相比,焓變增加值4.

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