異構(gòu)并行矩陣計(jì)算及其在致病基因預(yù)測(cè)中的應(yīng)用.pdf

1、隨著計(jì)算機(jī)科學(xué)技術(shù)和其他尖端技術(shù)的飛速發(fā)展，在天文學(xué)、航天航空、地質(zhì)勘探、氣象學(xué)、生物信息學(xué)、流體力學(xué)和社會(huì)信息學(xué)等很多的學(xué)科都產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù)，而對(duì)這些數(shù)據(jù)的處理可以歸結(jié)為具有特殊意義的矩陣上的計(jì)算問(wèn)題。在這樣的矩陣上面進(jìn)行計(jì)算求解往往需要消耗巨大的財(cái)力和物力。而大多數(shù)帶有實(shí)際應(yīng)用意義的矩陣計(jì)算往往屬于計(jì)算密集型操作，需要大量的迭代次數(shù)，需要很長(zhǎng)的時(shí)間去等待整個(gè)矩陣計(jì)算的完成，這對(duì)矩陣計(jì)算速度提升的要求變得原來(lái)越高。
　　圖形處

2、理單元(GPU)相比CPU有更高的浮點(diǎn)運(yùn)算能力，非常適合進(jìn)行數(shù)據(jù)并行計(jì)算。作為高性能計(jì)算領(lǐng)域的一個(gè)重要分支，GPU近幾年很快被應(yīng)用到科學(xué)和工程領(lǐng)域關(guān)鍵計(jì)算部分的加速工作中。值得注意的是，2013年11月發(fā)布的超級(jí)計(jì)算機(jī)TOP7中，使用GPU作為加速器的超級(jí)計(jì)算機(jī)系統(tǒng)已達(dá)57.1％。可以預(yù)見(jiàn)，GPU將是未來(lái)一段時(shí)間的主流高性能計(jì)算平臺(tái)。
　　針對(duì)矩陣計(jì)算內(nèi)存需求大、運(yùn)行周期長(zhǎng)等問(wèn)題，本文挑選出了具有代表性的一些科學(xué)與工程領(lǐng)域常見(jiàn)的矩