利用搜索推薦的方法對致病基因進(jìn)行推薦.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、生物信息學(xué)作為一門跨學(xué)科領(lǐng)域,簡單來說就是希望通過信息技術(shù)領(lǐng)域的成果來解決生物學(xué)領(lǐng)域待解決的問題。在生物醫(yī)學(xué)工作者在日常科研工作中,當(dāng)他們需要對與基因相關(guān)的疾病進(jìn)行研究時,往往需要對已有的大量文獻(xiàn)進(jìn)行檢索,找出基因和疾病之間的相關(guān)關(guān)系,從而能夠推進(jìn)科研工作的進(jìn)展。
  本文正是在這個場景下,基于信息抽取技術(shù),從實(shí)際的生物醫(yī)學(xué)文檔中,抽取出特定基因和特定疾病之間存在關(guān)系的證據(jù),并通過從上下文中提取特征,利用支持向量機(jī)對提取到的基因和

2、疾病之間的關(guān)系進(jìn)行真?zhèn)闻卸?。繼而,利用這些關(guān)系就可以形成了針對特定疾病的相關(guān)基因分布,用來判定與特定疾病相關(guān)的基因,并根據(jù)它們共同出現(xiàn)的頻率,給出相關(guān)基因的可信度。根據(jù)實(shí)驗(yàn),其給出的結(jié)果準(zhǔn)確率達(dá)到了近80%
  同時,利用類似的方法從文獻(xiàn)中提取出基因和基因之間的關(guān)系,并利用關(guān)系建立起一個基因之間相互作用的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。然后再利用與某一疾病相關(guān)的一系列基因作為種子基因,來從這個相互作用的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)中,找出其他可能與這個疾病相關(guān)的基因,從而

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