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1、20世紀70年代中期,卡爾.沃斯首先采用SSU rRNA序列研究原核生物的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系.現(xiàn)在許多生物學(xué)家仍將SSU rRNA樹看作標準的生命之樹.然而隨著各種原核生物基因組測序的完成,出現(xiàn)了許多推斷系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系的新方法.最近該組新發(fā)展起來一種基于短串的組份距離方法.它的最初方案使用整個蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集,得到了較好的結(jié)果.該文中我們采用每個物種的全部核糖體蛋白質(zhì)和氨酰tRNA合成酶為數(shù)據(jù)集,所得結(jié)果與其基本一致.特別是已知后一組蛋白質(zhì)在單獨
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