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文檔簡(jiǎn)介
1、麝是我國(guó)極其重要的資源動(dòng)物,由于亂捕亂獵和生境破壞,麝的數(shù)量急劇減少,瀕臨滅絕,現(xiàn)為國(guó)家一級(jí)重點(diǎn)保護(hù)野生動(dòng)物。目前對(duì)于麝的研究多為形態(tài)學(xué)、分類(lèi)學(xué)、組織學(xué)研究,但是少有用分子生物學(xué)方法對(duì)于麝進(jìn)行研究,尤其是對(duì)于麝的遺傳學(xué)方面的研究。 微衛(wèi)星DNA屬于共顯性的遺傳標(biāo)記,廣泛的存在于基因組內(nèi),含有豐富的多態(tài)性,能夠忠實(shí)反映個(gè)體特征,個(gè)體間的親緣關(guān)系,在人類(lèi)、家畜中已經(jīng)得到廣泛應(yīng)用,目前看來(lái)它是最適合于研究林麝遺傳多樣性問(wèn)題的工具。因此
2、,我們選擇了構(gòu)建林麝的微衛(wèi)星文庫(kù),篩選多態(tài)性好的座位對(duì)于林麝的遺傳多樣性進(jìn)行初步的分析。 在本次研究中,我們利用了鏈親和素和生物素之間有強(qiáng)親和的原理,構(gòu)建了林麝的三個(gè)堿基重復(fù)的微衛(wèi)星富集文庫(kù)(CAA)<,8>和(AGC)<,8>文庫(kù)各一個(gè)。每個(gè)文庫(kù)含有幾百個(gè)轉(zhuǎn)化子,用PCR的方法從2個(gè)文庫(kù)中篩選陽(yáng)性克隆。發(fā)現(xiàn)所建微衛(wèi)星富集文庫(kù)(CAA)<,8>和(AGC)<,8>中的陽(yáng)性克隆率大致為10%,而測(cè)序結(jié)果表明,用該方法篩選的陽(yáng)性克隆
3、中含有(CAA)<,n>和(AGC)<,n>重復(fù)比率不高,各找到含有(CAA)<,n>和(AGC)<,n>重復(fù)序列一個(gè)。又在以前建立的(AC)<,12>文庫(kù)中選取24個(gè)陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序,并對(duì)其進(jìn)行多態(tài)性篩選,找到較好多態(tài)性座位6個(gè)。 用這6個(gè)座位對(duì)于都江堰金風(fēng)山和馬爾康養(yǎng)殖場(chǎng)的圈養(yǎng)林麝做遺傳多樣性分析。這六個(gè)座位等位基因數(shù)量為4~7個(gè),平均每個(gè)座位在金鳳山居群中為5.5個(gè),馬爾康居群中為5.9個(gè);6個(gè)微衛(wèi)星座位在金鳳山居群中有效
4、等位基因數(shù)在3.076~5.628之間,而馬爾康居群有效等位基因數(shù)在3.032~4.654之間,而有效等位基因的平均值在兩個(gè)居群中的平均值分別為:4.235和3.834;金鳳山居群表觀(guān)雜合度(Ho)和期望雜合度(He)分別為0.3478~1.000和0.6748~0.8223,馬爾康居群表觀(guān)雜合度(Ho)和期望雜合度(He)分別為0.2083~0.9665和0.6701~0.7701;6個(gè)微衛(wèi)星座位的多態(tài)信息含量(PIC)最低為0.62
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