哺乳動物基因非翻譯區(qū)開放閱讀框架的分析.pdf

1、真核生物mRNA非翻譯區(qū)(UTR)閱讀框架在基因翻譯水平上具有重要的調(diào)控作用。本文統(tǒng)計(jì)了哺乳動物12991條5'UTR序列所含的上游開放閱讀框架(uORF)和15319條3'UTR序列所含的下游開放閱讀框架(dORF)的各種序列特性，討論了uORF作為可能的基因調(diào)控元件，不同于dORF的一些序列特征。
　　 本研究在所分析的5'UTR序列中約19%的序列在閱讀框1下含有AUG，約22%和24%的序列分別在閱讀框2和閱讀框3下含有

2、AUG。在這些AUG當(dāng)中，在閱讀框1下，86%的AUG是以uORF的形式出現(xiàn)的，在閱讀框2和閱讀框3下分別是71%和70%。而在所分析的3'UTR序列當(dāng)中，無論是在哪個(gè)閱讀框下，約71%含有AUG，其中約85%的AUG是以dORF的形式出現(xiàn)的；分析uORF序列和dORF序列以及與它們相應(yīng)的uIC序列(上游閱讀框間序列)和dIC序列(下游閱讀框間序列)長度，發(fā)現(xiàn)雖然3'UTR序列遠(yuǎn)遠(yuǎn)長于5'UTR序列，但是它們所包含的dORF和uORF長

3、度幾乎沒有差距，只是平均來說每一條3'UTR序列所包含的dORF數(shù)量明顯多于每一條5'UTR序列所包含的uORF數(shù)量，而且dIC比uIC長很多；uIC序列長度和其相應(yīng)的uORF序列長度之間不存在顯著的相關(guān)性，但dIC序列長度和其相應(yīng)的dORF序列長度之間具有極顯著的正相關(guān)關(guān)系。如果將閱讀框間序列(intersictronic sequence，IC序列)分為比其相應(yīng)的uORF(dORF)長和短的兩種情況，無論是uORF與uIC之間的相關(guān)