同一個體不同組織線粒體DNA異質性的研究.pdf

1、目的：建立變性高效液相色譜法(DHPLC)快速篩選同一個體不同組織線粒體DNA(mitochondrialDNA，mtDNA)高變區(qū)異質型的方法；同時采用直接測序法驗證其發(fā)生的頻率，為利用mtDNA進行法醫(yī)學鑒定時作出更加合理的結果解釋提供參考。 方法：收集尸體18例，分別提取血、心肌、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、胰腺、腦組織、肌肉、皮膚、肋骨、指甲及毛發(fā)的mtDNA，共制備樣本234份；并且在本實驗室選取三個已知序列的樣本Y1、Y

2、2和Y3。在高變區(qū)選取兩個多態(tài)性較好的區(qū)域即HVⅠ：nt16159-16391和HVⅡ：nt172-408，選用GoldTMDNA聚合酶分別進行擴增并且優(yōu)化擴增條件。用已知序列的樣本建立兩個區(qū)域各自最佳的DHPLC檢測條件；采用DHPLC圖譜和直接正反向測序法均相同的1＃個體的所有樣本建立篩選不同組織間異質型的模型。利用DHPLC篩選異質型樣本，篩選出的異質型樣本擴增更長的片段(包含目的片段)用ABI310遺傳分析儀進行正反向測序驗證。

3、 結果：DHPLC的最佳檢測溫度是HVⅠ：59.2℃，HVⅡ：55℃。DHPLC共篩選出11例個體具有異質性，而直接測序法驗證只有9例個體具有異質性，其中有4例為點異質型，6例為長度異質型，有1例既有點異質型又有長度異質型。觀察到異質型的個體中有4例每個個體的所有樣本均在相同的位置出現(xiàn)了相同的異質型；有2例出現(xiàn)了兩個堿基位置發(fā)生異質性的情況。各種組織出現(xiàn)異質型的頻率不完全相同，其范圍在27.8％-44.4％之間，其中肌肉組織出現(xiàn)