基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建方法研究.pdf

1、在后基因組時(shí)代，生物學(xué)所面臨的基本挑戰(zhàn)之一就是理解控制細(xì)胞活動(dòng)的復(fù)雜基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。隨著大量微陣列實(shí)驗(yàn)的進(jìn)行，給生命科學(xué)的研究帶來(lái)了豐富的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，利用這些實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)使在分子水平上研究細(xì)胞的功能成為可能。由于一個(gè)基因的表達(dá)會(huì)受到其他基因的影響，而這個(gè)基因又會(huì)影響其他基因的表達(dá)，這種相互影響相互制約的關(guān)系就構(gòu)成了復(fù)雜的基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。因此，基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)描述了多個(gè)基因之間協(xié)同完成不同任務(wù)的關(guān)系。通過(guò)構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，可以對(duì)某一

2、個(gè)物種或組織中的全部基因的表達(dá)關(guān)系進(jìn)行整體的模擬分析和研究，從而在系統(tǒng)的框架下認(rèn)識(shí)生命現(xiàn)象和揭示生命活動(dòng)的基本規(guī)律。
　　當(dāng)前貝葉斯網(wǎng)絡(luò)方法被廣泛用于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建，然而一些貝葉斯網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)算法需要使用已知的節(jié)點(diǎn)順序進(jìn)行結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)，如K2和TPDA-∏算法。在先驗(yàn)信息未知時(shí)，節(jié)點(diǎn)間的順序是不可能得到的，若使用隨機(jī)的節(jié)點(diǎn)順序進(jìn)行結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)，其準(zhǔn)確性將非常差，所以這在很大程度上限制了貝葉斯網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)方法的應(yīng)用。本文提出了一種推斷節(jié)