子午沙鼠和長爪沙鼠的分子系統(tǒng)地理學研究.pdf

1、子午沙鼠和長爪沙鼠是蒙新動物地理區(qū)生物多樣性的重要指示物種，并且分布范圍比較廣，特別是子午沙鼠。因此，它們可以作為研究蒙新區(qū)小型哺乳動物系統(tǒng)地理學比較理想的研究對象。本研究主要目標就是通過分析子午沙鼠和長爪沙鼠現(xiàn)有種群遺傳變異地理分布格局，試圖探討第四紀冰期及青藏高原近代的隆升等地質事件對我國蒙新區(qū)小型哺乳動物地理分布格局形成及進化的影響。 本研究測定了77個子午沙鼠和52個長爪沙鼠細胞色素b基因全序列，通過構建了單倍型的系統(tǒng)發(fā)

2、育樹和最小跨度網(wǎng)格圖，對子午沙鼠和長爪沙鼠系統(tǒng)地理格局和種群歷史進行探討，結果如下： (一)子午沙鼠的系統(tǒng)地理學研究 1．通過對19個采樣點77個子午沙鼠個體的Cyt6基因序列(1140bp)進行分析，發(fā)現(xiàn)共有212個核苷酸變異位點(179個轉換、33個顛換)，共定義了59種單倍型。單倍型多樣性(H)和核苷酸多樣性(π)分別為O.991和0.047。 2．NJ樹、MP樹和Network圖都提示子午沙鼠種群可以劃分

3、為東南、西北和天山3個主要類群。3個類群的分歧大約發(fā)生在1.46～2.18百萬年前，即更新世早期S冰緣期。并且F<,st>分析的結果也提示3個類群出現(xiàn)了顯著的遺傳分化(P<0.01)。其中塔克拉瑪干沙漠有可能是天山類群與東南類群隔離的地理障礙。 3．東南類群個體間的歧點分布呈單峰狀，并且Tajima檢驗 (D=-2.005，P<0.05)和Fu中性檢驗(Fs=-25.045，P<0.05)都是負值，提示該類群的子午沙鼠可能經(jīng)歷種

4、群增長和擴張事件。從單倍型在各地理單元中的分布來看，該類群未表現(xiàn)出明顯的系統(tǒng)地理格局。 (二)長爪沙鼠的系統(tǒng)地理學研究 1．基于6個種群52個長爪沙鼠個體的線粒體細胞色素b(Cyt b)基因全序列 (1140bp)的遺傳變異分析，共發(fā)現(xiàn)74個核苷酸變異位點，包含轉換和顛換位點分別為65個和9個，共定義37個單倍型。單倍型多樣性(H)和核苷酸多樣性(π)分別為0.976和0.007。 2.系統(tǒng)發(fā)育分析(NJ樹、MP

5、樹)表明37種單倍型聚為明顯的兩支(A和B支)，其中B支含有賀蘭山東部種群中的3種單倍型，而A支包括其余的單倍型，分歧時間約為260ka B.P，可能在廬山冰期(240-370ka B.P)經(jīng)歷了一次強烈的種群瓶頸，從而導致其種群的分歧，賀蘭山東部可能作為冰期避難所，包含于所有的譜系分支中。 3.Clade A個體間的歧點分布呈單峰狀，并且Tajima檢驗值 (D=-1.86，P<0.05)和Fu檢驗值(Fs=-21.89，P<