基因標(biāo)簽在腫瘤放射治療中的應(yīng)用.pdf

1、目的：在精準(zhǔn)醫(yī)療的時(shí)代，尋找與腫瘤預(yù)后或治療手段相關(guān)的生物標(biāo)記物在腫瘤的診治中至關(guān)重要?；驑?biāo)簽作為一種高通量的研究方法，已在多種腫瘤中被用于預(yù)測(cè)腫瘤預(yù)后以及治療相關(guān)的毒副作用。本課題擬研究基因標(biāo)簽在預(yù)測(cè)腫瘤預(yù)后，尤其是預(yù)測(cè)放射治療敏感性和放射治療相關(guān)毒性中的應(yīng)用。
　　方法：1）通過(guò)基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)（GEO），應(yīng)用訓(xùn)練集篩選出與乳腺癌患者預(yù)后相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNA）基因標(biāo)簽，并在三個(gè)獨(dú)立的測(cè)試集中進(jìn)行驗(yàn)證。2）將31

2、基因組成的放療敏感性基因標(biāo)簽，分別對(duì)來(lái)自基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)（GEO）以及腫瘤基因圖譜（TCGA）數(shù)據(jù)庫(kù)的腦膠質(zhì)瘤數(shù)據(jù)集進(jìn)行驗(yàn)證。根據(jù)患者基因表達(dá)水平分為放射治療敏感組（RS）以及放射治療抵抗組（RR），并分析該分型是否與患者的生存時(shí)間有關(guān)。
　　3）2014年6月至9月期間，依據(jù)入選標(biāo)準(zhǔn)，共19例T1c-T3a期、病理明確診斷為前列腺癌的患者納入碳離子治療前列腺癌臨床研究。我們提取患者外周血淋巴細(xì)胞 mRNA，進(jìn)行二代測(cè)序，在轉(zhuǎn)錄組水

3、平比較治療前后差異基因表達(dá)。研究終點(diǎn)為與碳離子治療相關(guān)的早期和晚期的毒副作用（根據(jù)CTCAE4.03評(píng)估）。我們將患者分為訓(xùn)練集及測(cè)試集兩組，通過(guò) Boruta算法，提取與毒副作用發(fā)生相關(guān)的特征基因，并利用機(jī)器學(xué)習(xí)分類(lèi)器，建立預(yù)測(cè)前列腺癌患者碳離子治療毒性的基因標(biāo)簽。
　　結(jié)果：1）我們篩選出四個(gè) lncRNA組成的基因標(biāo)簽，可以用于預(yù)測(cè)乳腺癌患者的預(yù)后。
　　2）在腦膠質(zhì)瘤中，根據(jù)放療敏感性基因標(biāo)簽，放射治療敏感組的生存率