慢性牙周炎患者和牙周健康人唾液微生物多樣性.pdf

1、目的:分析慢性牙周炎患者和牙周健康者唾液微生物群落結(jié)構(gòu)特點及差異，探尋慢性牙周炎可疑致病菌，為牙周病的細菌病因?qū)W發(fā)病機制提供一定的實驗依據(jù)。
　　方法:按照第三次全國口腔流行病學調(diào)查標準采集樣本，在甘肅臨夏地區(qū)篩選出24個慢性牙周炎患者唾液樣本和23個牙周健康者唾液樣本，分別標記為P組（慢性牙周炎患者唾液樣本）和H組（牙周組健康者唾液樣本）。提取細菌總DNA，檢測并通過PCR擴增目的片段V4V5區(qū)，采用GS454 FLX+測序，優(yōu)

2、化所得序列（刪除嵌合體和錯誤序列），然后應(yīng)用Qiime、MOTHUR、RDP、NCBI、MEGA等軟件進行相關(guān)的生物信息學分析。
　　結(jié)果：
　?。?）P組和H組兩組唾液樣本共得到2272個OTUs，歸屬于13個門，22個綱，39個目，80個科，159個菌屬；
　?。?）P組和H組共檢測出13個菌門分別為：厚壁菌門（Firmicute）、變形菌門(Proteobacteria）、放線菌門(Actinobacteria)

3、、擬桿菌門（cteroidetes)、梭桿菌門(Fusobacteria)、互養(yǎng)菌門(Synergistetes)、衣原體門（Chlamydiae）、綠彎桿菌門（Chloroflexi）、螺旋體門（Spirochaetes）、柔壁菌門（Tenericutes）、GN02、SR1以及TM7菌門。其中優(yōu)勢菌門（OTU檢出率>1％）為放線菌門、厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門、梭桿菌門和TM7，對菌門豐度進行秩和檢驗，發(fā)現(xiàn)13個菌門在兩組之間的差

4、異均無統(tǒng)計學意義（p>0.05）；
　　（3）P組和H組中共檢出11個共有優(yōu)勢菌屬，分別為放線菌屬（Actinomyces,P:3.94%。H:3.66%）、卟啉單胞菌屬（Porphyromonas,P:4.33%,H:4.13%）、普氏菌屬（Prevotella,P:6.96%,H:3.60%）、孿生球菌屬（Gemella,P:4.70%,H:5.56%）、顆粒鏈球菌屬（Granulicatella,P:4.54%,H:7.90

5、%）、乳桿菌屬（Lactobacillus,P:4.11%,H:1.67%）、鏈球菌屬（Streptococcus,P:36.35%,H:36.84%）、梭桿菌屬（Fusobacterium,P:4.42%,H:3.52%）、纖毛菌屬（Leptotrichia,P:1.47%,H:1.32%）、奈瑟菌屬（Neisseria,P:8.86%,H:12.68%）和(口動菌屬)勞特羅普氏菌屬（Lautropia,P:1.59%,H:2.36%

6、）；
　?。?）在兩組之間有差異的菌屬共有31個，其中韋永氏球菌屬、顆粒鏈球菌屬、陌生菌屬、隱秘小桿菌屬、擬桿菌_[G-3]、光崗氏菌屬、毛螺旋菌_[G-5]、沙特爾沃思菌屬、微單胞菌屬、消化鏈球菌_[XIII][G-1]、厭氧球形菌屬、農(nóng)桿菌屬、奧托氏菌屬和TM7_[G-5]在P組OTU含量相對高，而且韋永氏球菌屬和顆粒鏈球?qū)偈莾?yōu)勢菌屬；
　?。?）在RDA分析中屬梭菌目_[F-3][G-1]和毛螺旋菌科_[G-6]與牙周

7、病致病菌成正相關(guān)，且其OTU含量<0.01%。
　　結(jié)論：
　?。?）慢性牙周炎和牙周健康人口腔唾液微生物群落結(jié)構(gòu)存在一定異同；
　?。?）慢性牙周炎和牙周健康人口腔唾液微生物菌門豐度不同但種類可能恒定；
　?。?）慢性牙周炎和牙周健康人口腔唾液微生物中可能存在“口腔核心微生物組”；
　?。?）在慢性牙周炎組中OTU含量<0.01%的菌屬可能會影響整個口腔唾液微生物群落結(jié)構(gòu)，尤其是梭菌目_[F-3][G-1