mir-29家族對同一靶基因調(diào)控的熱力學性質(zhì)及其實驗研究.pdf

1、microRNAs是一類由19～23個核苷酸組成的小RNAs，其通過使靶mRNA降解或抑制靶mRNA翻譯的方式來調(diào)控基因表達。研究報道顯示microRNAs參與許多生物學過程，且microRNAs的發(fā)現(xiàn)對計算生物學和傳統(tǒng)生物學有很大影響。人類mir-29家族由mir-29a、mir-29b、mir-29c組成。研究表明，mir-29可調(diào)控人體細胞中參與細胞代謝、分化、凋亡、免疫等生物學過程相關(guān)的基因表達，且在多種腫瘤和疾病中發(fā)現(xiàn)mir-

2、29的異常表達。mir-29家族成員具有相同的種子序列，有一些研究暗示它們可能對同一靶mRNA的調(diào)控程度并不相同。
　　 本文主要研究mir-29家族成員對同一靶基因調(diào)控的熱力學性質(zhì)，并通過生物實驗對理論計算結(jié)果進行驗證。本文主要研究工作及結(jié)果如下：
　　 (1)本文通過三種預測軟件TargetScan、PicTar、miRanda預測mir-29家族的靶基因，并篩選出三種預測軟件共同的預測結(jié)果，從中挑選出與細胞周期及D

3、NA復制兩種生物學過程相關(guān)的4個靶基因，分別為REV3L、CDC42、CCND2、CDK6；
　　 (2)計算mir-29家族各成員分別與4個靶基因結(jié)合位點的自由能。自由能反應熱力學性質(zhì)的穩(wěn)定性，數(shù)值越小說明miRNA-mRNA結(jié)合越穩(wěn)定，microRNA對mRNA的調(diào)控程度可能越強。隨后為驗證理論設(shè)想是否正確，通過生物實驗對這一假想進行驗證；
　　 (3)生物學實驗所得結(jié)果與理論設(shè)想一致，miRNA-mRNA結(jié)合雙鏈的