黃河流域大鱗副泥鰍遺傳多樣性分析.pdf

1、大鱗副泥鰍(Paramisgurnus dabryanus)屬鯉形目、鰍科、副泥鰍屬，廣布于中國(guó)、日本和東南亞等國(guó)家，具有重要的使用價(jià)值和藥用價(jià)值。我國(guó)每年都出口大量的大鱗副泥鰍，日本、韓國(guó)需求量較大。然而隨著大鱗副泥鰍資源的進(jìn)一步深入開(kāi)發(fā)，再加上自然水域環(huán)境受到人為的破壞，大鱗副泥鰍的生產(chǎn)量逐年下降。如何合理開(kāi)發(fā)和保護(hù)我國(guó)現(xiàn)有大鱗副泥鰍資源已成為維護(hù)其產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的關(guān)鍵。
　　本研究通過(guò)對(duì)黃河流域不同地區(qū)大鱗副泥鰍線(xiàn)粒體的12

2、SrRNA、16SrRNA、CO1基因片段的PCR擴(kuò)增、序列測(cè)定和軟件分析，從序列變異和遺傳多樣性、種群遺傳結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)地理以及種群動(dòng)態(tài)三個(gè)方面進(jìn)行分析。希望能為今后的資源保護(hù)及其漁業(yè)管理提供理論依據(jù)。
　　大鱗副泥鰍12S rRNA基因片段長(zhǎng)度為398bp，在28個(gè)個(gè)體中檢測(cè)到7個(gè)單倍型，總?cè)后w單倍型多樣性指數(shù)(HD)0.442，核苷酸多樣性指數(shù)(Pi)0.00214，平均核苷酸差異數(shù)(K)0.849；16S rRNA基因片段長(zhǎng)度

3、為621bp，在32個(gè)個(gè)體中檢測(cè)到16個(gè)單倍型，總?cè)后w單倍型多樣性指數(shù)(HD)0.847，核苷酸多樣性指數(shù)(Pi)0.00683，平均核苷酸差異數(shù)(K)3.530；CO1擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為655bp，檢測(cè)的28個(gè)個(gè)體中共獲得14個(gè)單倍型，單倍型多樣性指數(shù)(H)為0.757，平均核苷酸多樣性指數(shù)(Pi)達(dá)0.0032，平均核苷酸差異數(shù)(K)2.108。16S rRNA與CO1對(duì)大鱗副泥鰍遺傳多樣性的檢測(cè)高于12S rRNA的檢測(cè)。
　　

4、對(duì)3個(gè)群體的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行檢測(cè)表明，黃河流域大鱗副泥鰍群體不存在顯著的群體分化。三群體間12S rRNA分化系數(shù)Fst達(dá)0.07645(p<0.01)，基因流為6.0402；AMOVA檢測(cè)顯示92.36％的遺傳差異存在于群體內(nèi)部，7.64％的遺傳差異存在于群體間。對(duì)于16SrRNA，三群體間分化系數(shù)Fst達(dá)0.15576(p<0.01)，基因流為31.6007；AMOVA檢測(cè)顯示84.42％的遺傳差異存在于群體內(nèi)部，15.58％的遺傳差異

5、存在于群體間。CO1三群體間分化系數(shù)Fst達(dá)0.08349(p<0.01)，基因流大于4。AMOVA檢測(cè)顯示91.65％的遺傳差異存在于群體內(nèi)部，而8.35％的遺傳差異存在于群體間。三地區(qū)大鱗副泥鰍交流較為充分。聚類(lèi)分析和單倍型網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖證實(shí)黃河流域山西臨汾，河南新鄉(xiāng)及山東濟(jì)南三地區(qū)大鱗副泥鰍群體并無(wú)顯著地理分化，且享有共用單倍型。
　　Arlequin3.11軟件計(jì)算的黃河流域大鱗副泥鰍三群體中三種分子標(biāo)記的Tajima’s D