雌激素代謝相關(guān)基因位點(diǎn)及其單倍型與中國(guó)漢族女性初潮年齡的群體關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、【目的】
　　通過(guò)對(duì)歐美人群中多次證實(shí)與初潮年齡相關(guān)的雌激素合成與代謝相關(guān)的基因如細(xì)胞色素P450家族19A1（cytochrome P450, family19, subfamily A, polypeptide1，CYP19A1），雌激素受體1（estrogen receptor1，ESR1）,雌激素受體2（estrogen receptor2，ESR2）及孕酮受體（progesterone receptor，PGR）共4個(gè)基

2、因及其多態(tài)性位點(diǎn)的基因分型，了解上海及其周邊地區(qū)無(wú)親緣關(guān)系的漢族女性初潮年齡的頻率分布及其初潮年齡早晚的變異關(guān)系。
　　【資料與方法】
　　通過(guò)對(duì)2011年12月至2012年5月來(lái)我院體檢上海及其周邊地區(qū)2000多例健康成年女性面對(duì)面問(wèn)卷形式搜集基本信息資料，包括年齡、民族、身高、體重、既往病史等，對(duì)所有研究對(duì)象記錄其初潮年齡、生育、哺乳、避孕藥的應(yīng)用等，并提取外周血基因組DNA。利用國(guó)際人類(lèi)基因組計(jì)劃數(shù)據(jù)庫(kù)（Hapmap）

3、，設(shè)定連鎖不平衡系數(shù)r2>0.8，最小等位基因頻率(MAF)>0.05，選取CYP19A1、ESR1、ESR2、PGR共4個(gè)基因的24個(gè)SNP位點(diǎn)（rs12148604、rs2255192、rs4646、rs2470144、rs6493496、rs2470176、rs700519、rs28757184、rs8029807、rs1062577、rs3798577、rs9340799、rs2234693、rs2228480、rs377808

4、2、rs3798758、rs928554、rs1255998、rs8018687、rs4986938、rs1256049、rs484389、rs518162、rs1042838），使用SNP scan分型技術(shù)鑒定1791例標(biāo)本的24個(gè)SNP分型。并對(duì)全部病例資料進(jìn)行運(yùn)用群體關(guān)聯(lián)分析方法如卡方檢驗(yàn)、逐步回歸分析、線(xiàn)性回歸分析、ANOVA法等方法分析該4個(gè)基因及其多態(tài)性位點(diǎn)與女性初潮年齡的關(guān)系，并通過(guò)PLINK分析軟件計(jì)算各位點(diǎn)間的連鎖不平

5、衡關(guān)系及其單倍型塊與初潮年齡早晚差異的關(guān)系。
　　【結(jié)果】
　　本研究人群中，除rs1062577和rs3798758外，其余22個(gè)等位基因和基因型分布符合Hardy-Weinberg定律。采用單因素方差（ANOVA）分析：rs6493496與初潮年齡早晚的差異P值接近0.05（p=0.056），可能是初潮年齡變異的易感位點(diǎn)，rs3798577可見(jiàn)年齡分層（P=0.042），rs518162可見(jiàn)身高分層（P=0.047）；而

6、線(xiàn)性回歸分析顯示：rs6493496與初潮年齡早晚的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（p=0.01038），其余23個(gè)等位基因型和單倍型分析未發(fā)現(xiàn)與初潮年齡早晚變異間存在相關(guān)性。
　　【結(jié)論】
　　1.本研究首次分析了CYP19A1、ESR1、ESR2、PGR這四個(gè)基因SNPs及其單倍型與上海及其周邊地區(qū)無(wú)親緣關(guān)系的女性初潮年齡早晚變異的關(guān)系；2.本研究發(fā)現(xiàn)CYP19A1基因的rs6493496位點(diǎn)可能是該地區(qū)女性初潮年齡早晚變異的易感位點(diǎn)