甜瓜伐昔洛韋水解酶和持綠蛋白基因家族的全基因組鑒定及分析.pdf

1、學校代碼：10126分類號：Q2論文題目學號：212Q晝Q!魚編號：甜瓜伐昔洛韋水解酶和持綠蛋白基因家族的全基因組鑒定及分析學院：生金科堂堂院專業(yè)：生物化堂皇盆王生物堂研究方向：植物僉王生物堂拯基因工程姓名：巴德仨貴指導教師：哈逝圓直撞數(shù)援2016年11月23日內(nèi)蒙古大學博士學位論文甜瓜伐昔洛韋水解酶和持綠蛋白基因家族的全基因組鑒定及分析摘要甜瓜(CucumismeloL)是世界十大水果之一，具有重要的經(jīng)濟價值，也是研究葫蘆科植物果實發(fā)

2、育成熟的模式植物。2012年6月甜瓜全基因組測序已完成并公布，為利用生物信息學方法研究新基因及其功能奠定了基礎。本研究利用生物信息學方法從甜瓜基因組中鑒定了伐昔洛韋水解酶(valacyclovirhydrolase，VACVase)、持綠蛋白(staygreenprotein，SGR)和非黃化蛋白(nonyellowcoloring，NYC)基因家族，并進行了生物信息學、表達特性、亞細胞定位和功能分析。主要結(jié)果如下：1)本文從甜瓜基因組

3、中鑒定得到兩個VACVase，命名為CmVACVasel和CmVACVase2，通過生物信息學分析表明，該蛋白家族高度保守，兩個蛋白均無信號肽結(jié)構(gòu)，屬于非分泌性蛋白，CmVACVasel和CmVACVase2分別含有4個和3個跨膜結(jié)構(gòu)，屬于跨膜蛋白，且分別含有24和15個磷酸化位點。通過啟動子分析發(fā)現(xiàn)，除了核心元件(CAATbox、TATAbox、5“UTRPyrich等)外，含有多種激素應答元件、組織特異表達以及時空特異表達的調(diào)控元件