DNA條形碼在喇叭河和瓦屋山兩棲爬行類物種多樣性調(diào)查中的應(yīng)用研究.pdf

1、為調(diào)查四川省瓦屋山省級自然保護區(qū)和喇叭河省級自然保護區(qū)內(nèi)的兩棲爬行類物種的多樣性，并進一步驗證DNA條形碼技術(shù)的可靠性以及COⅠ基因序列作為標(biāo)記基因的可行性。本文對這兩個保護區(qū)內(nèi)的兩棲類和爬行類物種進行了采樣，共采集到239個樣本，使用傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)方法和DNA條形碼技術(shù)對采集到的樣本做出鑒定。以兩棲類DNA條形碼COⅠ序列通用引物擴增樣本的COⅠ序列作為標(biāo)記基因，同時使用通用引物擴增樣本的16SrRNA和Cyt b序列作為補充序列。研究

2、結(jié)果如下:
　　喇叭河自然保護區(qū)共鑒定物種12種，其中兩棲綱2目5科7種，爬行綱2目3科5種;瓦屋山自然保護區(qū)共鑒定物種26種，其中兩棲綱2目6科18種，爬行綱1目2科8種。在所有被鑒定的物種中，除了一個齒蟾屬物種的3個樣本無法做出準(zhǔn)確鑒定以及一個銅蜓蜥物種的樣本存在隱存種的可能性需要進一步研究以外，其余物種均做出準(zhǔn)確鑒定。本文將測得的序列上傳至GenBank中，如大齒蟾、經(jīng)甫樹蛙和瓦屋山腹鏈蛇等11個物種的COⅠ序列都是第一次被

3、測得，這些序列的上傳能夠為以后的DNA條形碼研究提供數(shù)據(jù)。本文研究表明，Che等發(fā)表的兩棲類DNA條形碼通用引物很好的解決了兩棲類中存在的引物通用性問題，并且相比較于16SrRNA基因，COⅠ基因在兩棲爬行類DNA條形碼鑒定中是更適合的標(biāo)記基因，這和先前的研究結(jié)果是一致的，但本文同時也發(fā)現(xiàn)，在目前階段，GenBank數(shù)據(jù)庫中COⅠ序列的數(shù)據(jù)還遠(yuǎn)未完善以及數(shù)據(jù)庫中有更多的16S序列，補充測定16S、Cytb等序列能夠更好、更準(zhǔn)確的對物種做