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文檔簡介
1、有機(jī)磷農(nóng)藥(Organophosphate pesticides,OPs)是目前全世界廣泛使用的一類農(nóng)藥,是主要的農(nóng)藥污染源。由此所引發(fā)的環(huán)境污染嚴(yán)重威脅人畜生命安全,制約著經(jīng)濟(jì)和社會可持續(xù)發(fā)展。篩選高效廣譜的農(nóng)藥降解功能菌,通過環(huán)境微生物或微生物源酶制劑來消除有機(jī)磷農(nóng)藥污染具有效率高、成本低、降解徹底、無二次污染等優(yōu)點,是修復(fù)有機(jī)磷農(nóng)藥污染土壤的有效途徑之一,并已成為相關(guān)研究的熱點。本研究從長期受有機(jī)磷農(nóng)藥污染的環(huán)境中分離得到兩株有機(jī)
2、磷農(nóng)藥高效降解菌,并對其降解特性、代謝途徑、分子機(jī)制和初步應(yīng)用等方面進(jìn)行了研究。 從湖北沙隆達(dá)農(nóng)藥廠廢水污泥和湖北黃岡市長期施用有機(jī)磷農(nóng)藥的棉田土壤中取樣,分離得到兩株有機(jī)磷農(nóng)藥高效降解菌HS-D36和HS-D38。HS-D36能高效降解甲基對硫磷(Methyl parathion,MP),但對農(nóng)藥中間體對硝基苯酚(p-Nitrophenol,PNP)降解能力相對較弱;而HS-D38能高效降解高濃度對硝基苯酚,并以它作為唯一的
3、碳源和氮源生長,但該菌只能部分降解甲基對硫磷。對兩株降解菌進(jìn)行了形態(tài)觀察和生理生化鑒定,結(jié)合16s rDNA分子水平鑒定,HS-D36鑒定為施氏假單胞菌屬(Pseudomonas stutzeri),HS-D38鑒定為銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)。研究表明,HS-D36能于3h內(nèi)對50 mg/L甲基對硫磷降解率達(dá)到90%,12h內(nèi)將50 mg/L對硝基苯酚完全降解;HS-D38能部分降解50 mg/L甲基
4、對硫磷,降解過程沒有對硝基苯酚的積累,并在12h內(nèi)將500 mg/L的高濃度對硝基苯酚完全降解。廣譜特性研究表明,HS-D36菌株24h內(nèi)對50 mg/L的毒死蜱和甲胺磷降解率達(dá)到80%以上,能部分降解辛硫磷、三唑磷和樂果:Hs-D38能降解50 mg/L乙酰甲胺磷、毒死蜱和樂果降解率達(dá)70%以上,對三唑磷和甲胺磷也有較強(qiáng)的降解能力,表現(xiàn)出較好的廣譜降解特性。兩菌株對有機(jī)磷農(nóng)藥及其中間產(chǎn)物的高效降解鮮見報道。 以HS-D36基
5、因組DNA為模板,設(shè)計特異性引物,PCR擴(kuò)增并克隆了有機(jī)磷水解酶基因opd(長為996bp,GenBank NΩ:EF515812)。對測序結(jié)果進(jìn)行Blast比對,同源分析發(fā)現(xiàn),opd基因與來自于甲基對硫磷降解菌Pseudomonas sp.WBC-3的mpd基因同源性高達(dá)99%。將opd基因亞克隆到高效表達(dá)載體pET-28a,構(gòu)建重組表達(dá)載體pET-opd,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21菌株中進(jìn)行原核表達(dá)。SDS-PAGE分析可見35kD處有
6、一強(qiáng)特異性條帶。通過超聲波裂解細(xì)胞,提取甲基對硫磷水解酶粗酶液,對酶學(xué)特性進(jìn)行了研究。OPD酶的最適作用溫度為30℃、最適pH值為10.0,金屬離子Zn2+、Cd2+、Fe3+、Cr2+、Co2+對酶活力有不同程度的激活效應(yīng),Na+、Ni2+、Cu2+、K+、Mg2+則對其活性有抑制作用。 運用生物信息學(xué)手段,對目前國內(nèi)外已經(jīng)報道的有機(jī)磷水解酶基因進(jìn)行了系統(tǒng)檢索和同源比對。結(jié)果表明,來自不同菌株的OPD、MPD、OPH和MPH
7、等都屬于有機(jī)磷水解酶家族。有機(jī)磷水解酶OPD與來自Pseudomonas sp.WBC-3的甲基對硫磷水解酶MPD(AAP06948.1)的同源性高達(dá)99.0%,而與來自于Flavobacterium sp.的對硫磷水解酶PTE(AAA24930.1)和來自于Escherichia coli K-12磷酸三酯酶PTE(AAA58176.1)的同源性都很低。OPD的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果表明,在opd基因序列開放閱讀框中有四個保守區(qū)域,分別定位
8、于48-56,131-145,225-230,290-297之間,該區(qū)域中α-螺旋和β-折疊二級結(jié)構(gòu)豐富。定位于137-145和225-230之間的氨基酸殘基所形成的結(jié)構(gòu)域與β-內(nèi)酰胺酶家族結(jié)構(gòu)域一致,表明OPD屬于β-內(nèi)酰胺酶家族。以MPD(PDBID:1P9E)為模板,對OPD酶的三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行同源模建分析。結(jié)果表明,OPD酶的三級結(jié)構(gòu)由兩個獨立的同型單體組成,每個單體由兩個αβ/βα二聚體折疊而成,二聚體含金屬離子活性中心前體,金屬
9、離子中心附近的空穴代表底物結(jié)合位點。成熟的OPD酶由含二價金屬離子Zn2+和Cd2+的兩個同型單體緊密結(jié)合形成的金屬酶。 薄層色譜(TLC)結(jié)合光譜學(xué)(UV-vis Spectra)分析表明,HS-D36降解MP的第一步代謝主要中間產(chǎn)物為PNP。通過化學(xué)萃取HS-D38降解PNP的降解液中間產(chǎn)物,進(jìn)一步運用GC和LC-ESI/MS等方法,確定了HS-D38對PNP降解的關(guān)鍵中間產(chǎn)物是對苯二酚(HQ)和1,2,4-苯三酚(1,2
10、,4-BT)等。底物利用實驗表明,HS-D38能較好利用HQ和1,2,4-BT。上述結(jié)果表明HS-D38是經(jīng)過HQ途徑降解PNP。初步確定了HS-D36和HS-D38協(xié)同礦化MP的最終代謝途徑,即通過HS-D36降解MP生成PNP,而PNP在HS-D38的降解作用下,經(jīng)HQ途徑進(jìn)一步降解生成HQ,HQ經(jīng)羥化生成1,2,4-BT,并最終進(jìn)入TCA循環(huán),礦化為無機(jī)小分子物質(zhì)。HQ轉(zhuǎn)化為1,2,4-BT在假單胞菌屬中首次發(fā)現(xiàn)和報道。
11、 外加碳源和氮源對菌株的降解實驗表明,HS-D38在ANM培養(yǎng)基中,對PNP的降解速度明顯加快,而在ACM培養(yǎng)基中降解速度減慢。HS-D36降解MP和HS-D38降解PNP的反應(yīng)均符合一級反應(yīng)動力學(xué),模擬結(jié)果與動態(tài)掃描分析結(jié)果一致。而外加碳源和氮源對HS-D36降解MP都具有促進(jìn)作用。不同菌株對模擬農(nóng)藥廢水中COD的去除能力不同,投加混合菌群較投加單一菌株效果更理想,對COD的去除率高達(dá)73.0%,而添加一定量的碳源和氮源,混合菌株對模
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