雞微衛(wèi)星標(biāo)記、DNA甲基化差異和FSHβ變異及其與體重和產(chǎn)蛋性狀的關(guān)系.pdf

1、本文研究了濟寧百日雞群體遺傳多樣性現(xiàn)狀，探查了文昌雞DNA甲基化水平對其主要體重和產(chǎn)蛋性狀的影響，揭示了FSHβ基因的遺傳變異及其標(biāo)記基因型對雞性早熟等繁殖性狀的影響，可為從遺傳上提高或改良雞的體重和產(chǎn)蛋性狀和培育優(yōu)質(zhì)雞的標(biāo)記輔助選擇和早期選種提供重要數(shù)據(jù)。本研究主要從候選基因的遺傳變異和DNA甲基化水平等基因表達調(diào)控方面，研究了影響優(yōu)良地方雞種群體遺傳多樣性及其生長與繁殖性狀的遺傳因素。主要研究結(jié)果如下：
　　 ⑴采用微衛(wèi)星標(biāo)

2、記方法，以60只濟寧百日雞為研究對象，選用分布于家雞的22條染色體的25對微衛(wèi)星引物中多態(tài)性豐富的10對微衛(wèi)星位點，檢測了濟寧百日雞群體遺傳多樣性現(xiàn)狀，并篩查了與其性早熟及其產(chǎn)蛋性狀相關(guān)的分子遺傳標(biāo)記。共檢測到29個等位基因，基因平均雜合度（H）為0.348，多態(tài)信息含量（PIC）為0.511。發(fā)現(xiàn)了4個微衛(wèi)星座位的不同基因型早期產(chǎn)蛋性能之間的差異達到顯著（P＜0.05）或極顯著水平（P＜0.01）。其中，顯著影響濟寧百日雞開產(chǎn)日齡的有

3、利基因型分別為MCW0252位點的AA型、MCW0029位點的CC型和MCW0097位點的AA型；不利基因型分別為MCW0252位點的AB型、AC型、AD型、CD型和DD型、MCW0029位點的CD型、MCW0097位點的AC型。顯著影響濟寧百日雞43周齡產(chǎn)蛋量的有利基因型分別為ADL0190位點的AB型、MCW0252位點的AD、BB和AC型和MCW0029位點的CC型；不利基因型分別為ADL0190位點的BB型、MCW0252位點的

4、DD型、MCW0029位點的AE型、CD型和DD型。
　　 ⑵采用MSAP技術(shù)，檢測了36只文昌雞的DNA甲基化水平，按DNA總甲基化水平將各個體分為6組，并將DNA總甲基化水平與其體重和產(chǎn)蛋性狀進行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明：組間的總甲基化水平差異極顯著（P＜0.01）；文昌雞開產(chǎn)日齡、20周齡產(chǎn)蛋量、32周齡產(chǎn)蛋量、36周齡產(chǎn)蛋量、43周齡產(chǎn)蛋量及其46周齡產(chǎn)蛋量在個體總甲基化差異水平之間存在極顯著的差異（P＜0.01），6周齡體重

5、及其14周齡體重在個體總甲基化差異水平之間存在顯著的差異（P＜0.05）。體重和產(chǎn)蛋性狀間相關(guān)性分析表明，開產(chǎn)日齡與20周齡產(chǎn)蛋量、32周齡產(chǎn)蛋量、36周齡產(chǎn)蛋量、43周齡產(chǎn)蛋量及其46周齡產(chǎn)蛋量彼此之間，6周齡體重、8周齡體重及其14周齡體重彼此之間,20周齡體重與20周齡產(chǎn)蛋量、32周齡產(chǎn)蛋量、36周齡產(chǎn)蛋量、43周齡產(chǎn)蛋量、46周齡產(chǎn)蛋量、14周齡體重、18周齡體重之間相關(guān)極顯著（P＜0.01）。20周齡產(chǎn)蛋量與18周齡體重之間,

6、20周齡體重與6周齡體重、8周齡體重之間相關(guān)顯著（P＜0.05）。
　　 ⑶比較研究了濟寧百日雞、蘆花雞和萊蕪黑雞FSHβ基因序列外顯子1、外顯子3及其內(nèi)含子1的單核苷酸多態(tài)性。結(jié)果，在外顯子1區(qū)域未發(fā)現(xiàn)單核苷酸突變位點；exon3區(qū)域發(fā)現(xiàn)一個單核苷酸突變位點：A2540C；內(nèi)含子1區(qū)域發(fā)現(xiàn)兩個單核苷酸突變位點：C712T和A912C。采用PCR-SSCP方法檢測3種雞外顯子3區(qū)域的多態(tài)性，結(jié)果發(fā)現(xiàn)：濟寧百日雞和蘆花雞外顯子3處

7、均檢測到AA、BB和AB三種基因型，而萊蕪黑雞只檢測到AA一種基因型。克隆測序發(fā)現(xiàn)，檢測到的單核苷酸突變位點為A2540C。統(tǒng)計分析結(jié)果表明：濟寧百日雞FSHβ基因外顯子3區(qū)域的BB型雞的開產(chǎn)日齡早于AB型和AA型雞；AB型雞的43周齡產(chǎn)蛋量多于AA型和BB型雞，AA型雞的畸形蛋數(shù)少于AB型和BB型雞，但三者的差異均不顯著（P＞0.05）。蘆花雞FSHβ基因外顯子3區(qū)域的BB型雞的開產(chǎn)日齡早于AA型和AB型雞；AB型雞的43周齡產(chǎn)蛋量多