30300.中國金線側(cè)褶蛙種組的系統(tǒng)地理學(xué)

1、南京師范大學(xué)博士學(xué)位論文中國金線側(cè)褶蛙種組的系統(tǒng)地理學(xué)姓名：戴建華申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：生物學(xué)；動物學(xué)指導(dǎo)教師：周開亞20090524摘要II線側(cè)褶蛙的13個有效的微衛(wèi)星位點。在30只個體中，位點的等位基因數(shù)為513，平均8.38。觀測雜合度（observedheterozygositiesHO）在0.5330.890之間，平均值為0.686；期望雜合度（expectedheterozygositiesHE）在0.6200.897之間

2、，平均值為0.751。為了檢測金線側(cè)褶蛙SSR引物的通用性，對蛙科其它5個種（每種8只）進行了擴增。結(jié)果表明，13個位點可在側(cè)褶蛙屬3個種（Pelophylaxhubeiensis，Pelophylaxfukienensis，Pelophylaxnigromaculata）中擴增，其中的8個位點能在測試的所有物種中擴出。實驗結(jié)果提示這13對引物在側(cè)褶蛙屬中的通用性非常好，除適合用于種群內(nèi)的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)以及基因流分析外，也可用于同

3、屬物種以及其它蛙科近緣物種之間的系統(tǒng)發(fā)生研究。4中國金線側(cè)褶蛙種組的種群遺傳結(jié)構(gòu)和進化歷史中國金線側(cè)褶蛙種組的種群遺傳結(jié)構(gòu)和進化歷史測定了三種側(cè)褶蛙mtDNA控制區(qū)5’端和cytb全長序列。3種側(cè)褶蛙的cytb基因全序列長度均為1143bp，5’CR序列長度在708772bp。比對后，在福建側(cè)褶蛙、湖北側(cè)褶蛙和金線側(cè)褶蛙cytb中分別發(fā)現(xiàn)了194個、120個和158個變異位點，分別定義了28種、63種和87種單元型，其中4種、11種和1

4、2種單元型為地方種群間共享單元型，其余單元型為地方種群內(nèi)特有；在福建側(cè)褶蛙、湖北側(cè)褶蛙和金線側(cè)褶蛙5’CR中分別發(fā)現(xiàn)了423個、108個和139個變異位點，分別定義了30種、79種和102種單元型，其中分別有5種、10種和14種單元型為地方種群間共享單元型，其余單元型為地方種群內(nèi)特有。將所有地方種群合并為一個大種群所做的分析表明，福建側(cè)褶蛙、湖北側(cè)褶蛙和金線側(cè)褶蛙的線粒體單元型多樣性相當高（福建側(cè)褶蛙、湖北側(cè)褶蛙和金線側(cè)褶蛙cytb單元

5、型多樣性分別為0.8680.021，0.9550.010和0.9660.003；5’CR單元型多樣性分別為0.9220.010，0.9790.004和0.97310.0030），總體核苷酸多樣性也較高（福建側(cè)褶蛙、湖北側(cè)褶蛙和金線側(cè)褶蛙cytb核苷酸多樣性分別為0.041250.00514，0.018490.00093和0.019730.00060；5’CR核苷酸多樣性分別為0.051240.00507，0.028570.00117和0

6、.029390.00067）。應(yīng)用線粒體DNA的cytb基因全序列和控制區(qū)5’端部分序列探討了金線側(cè)褶蛙種組的系統(tǒng)地理格局和種群遺傳結(jié)構(gòu)。基于線粒體cytb和5’CR序列構(gòu)建了單元型系統(tǒng)發(fā)生樹，進行了種群遺傳變異分析及歧點分布分析。系統(tǒng)發(fā)生樹和單元型之間的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖都表明福建側(cè)褶蛙、湖北側(cè)褶蛙和金線側(cè)褶蛙種群都包括明顯的兩大支系?；赾ytb序列數(shù)據(jù)，用MDIV軟件計算三種側(cè)褶蛙主要支系之間的分歧時間，結(jié)果顯示福建側(cè)褶蛙2個支系的分歧時