黃鯽群體形態(tài)學及遺傳學研究.pdf

1、黃鯽(Setipinna tenuifilis)隸屬于鯡形目(Clupeiformes)、鳀科(Engraulidae)、黃鯽屬(Setipinna),廣泛分布于印度洋西部至西北太平洋近海海域,在中國渤海、黃海、東海和南海各沿海均有分布,是一種重要的小型經濟魚類。隨著傳統(tǒng)經濟魚類資源量下降,黃鯽等小型經濟魚類承受的捕撈壓力越來越大,其自然資源量已呈現下降趨勢。本研究通過形態(tài)學和遺傳學研究系統(tǒng)地比較了黃鯽不同群體間的遺傳多樣性和遺傳結構,

2、討論并揭示其地理格局的形成機制,旨在為黃鯽資源的合理利用和科學管理提供基礎資料和理論依據。
　　1、黃鯽群體形態(tài)學研究
　　(1)使用傳統(tǒng)形態(tài)學和框架形態(tài)學對中國近海5個黃鯽群體(東營、青島、溫州、廈門和北部灣)共129尾個體進行形態(tài)學測量,利用判別分析等方法對測量的30個形態(tài)學指標(包括7個分節(jié)特征、23個量度特征)進行多元統(tǒng)計分析。分節(jié)特征結果顯示各群體間差異不顯著;單因子方差分析結果顯示廈門群體和北部灣群體存在16個指

3、標的差異不顯著,北部灣群體和溫州群體存在14個指標的顯著性差異;判別分析結果顯示各群體判別正確率為90.9％-100%,綜合判別正確率為94.5%,判別分析散點圖顯示北部灣群體和廈門群體聚為一團,其他各群體分別聚為一團;主成分分析結果顯示前8個主成分解釋82.5%的形態(tài)差異,形態(tài)差異主要集中在魚體頭部和尾部;聚類分析結果顯示北部灣群體和廈門群體首先聚為一支,最后與溫州群體聚為一支。分析結果表明溫州群體較其他群體形態(tài)特征存在較大差異,這一

4、結果可能是由于溫州靠近長江入?？?淡水的輸入對近海海水理化性質等環(huán)境因素的影響所造成的。
　　(2)通過形狀指標法和橢圓傅里葉分析方法對中國近海5個黃鯽群體(東營、青島、溫州、廈門和北部灣)共129尾個體的耳石形態(tài)特征進行分析研究,實驗結果與形態(tài)學研究結果相一致。多元統(tǒng)計分析結果顯示溫州群體較其他群體耳石形態(tài)特征存在較大差異,可能原因是由于長江入海的淡水對溫州近海海水溫度、鹽度等環(huán)境因子產生較大影響,從而對黃鯽耳石形態(tài)產生影響。<

5、br>　　2、黃鯽群體遺傳學研究
　　(1)為檢測中國近海黃鯽群體的遺傳結構和遺傳差異,我們對7個黃鯽群體(東營、煙臺、青島、南通、溫州、廈門和北部灣)共153尾個體的線粒體控制區(qū)進行擴增,對長度為489-567 bp的線粒體控制區(qū)高變區(qū)進行比較分析。結果顯示各群體均呈現出較高的單倍型多樣度和較低的核苷酸多樣度;在控制區(qū)高變區(qū)前段存在長度為39 bp的串聯重復序列單元,重復次數為5-7次。其中北部灣群體中7次重復的個體比例較大,其

6、他群體6次重復的個體比例較大,串聯重復序列多態(tài)性表明北部灣群體與其他群體存在遺傳差異;單倍型鄰接關系樹未檢測到與地理分布相一致的譜系結構;將東營、煙臺、青島和南通群體劃分為黃渤海組群,溫州和廈門群體劃分為東海組群,北部灣群體劃分為南海組群,分組群的AMOVA分析和Fst值結果顯示黃渤海組群與東海組群和南海組群間均存在顯著的遺傳差異;各組群中性檢驗結果均為顯著負值,核苷酸不配對分布呈現單峰狀態(tài),表明均經歷過近期的群體擴張事件。參照線粒體控

7、制區(qū)基因5%-10%/MY(百萬年)的分歧速率,推測黃鯽黃渤海組群的擴張時間大約為97400-194800年前,東海組群的擴張時間大約為45700-91500年前,南海組群的擴張時間大約為17300-34500年前。遺傳學分析結果顯示更新世冰期可能對中國近海黃鯽群體的空間分布和信息交流造成較大影響;中國近海黃鯽群體可能分為3個不同的漁業(yè)管理單元,在漁業(yè)管理中應區(qū)別對待。
　　(2)對黃鯽線粒體DNA控制區(qū)結構進行分析,得到黃鯽線粒

8、體DNA控制區(qū)長度為1193-1271bp,識別了終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū)。進行了擴展終止相關序列ETAS(TACAT和ATGCA)和6個保守片段(CSB-D、E、F和CSB-1、2、3)分析并給出各保守片段的特征序列。對202尾黃鯽個體控制區(qū)高變區(qū)(hypervariable region I)序列長度進行統(tǒng)計,結果顯示在黃鯽個體內未發(fā)現長度異質性(heterogeneous)現象,長度多態(tài)性僅出現在個體間。對黃鯽個體重復序