黃瓜HD-ZipⅠ類轉(zhuǎn)錄因子的生物信息學(xué)及功能分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、黃瓜（Cucumis sativus L.）是我國主要的設(shè)施蔬菜。卷須是黃瓜重要的性狀之一，在豆類的研究中表明，卷須是由HD-ZipⅠ類轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的。HD-Zip家族是植物中最大的幾個家族之一。從低等的蘚類植物到被子植物都有發(fā)現(xiàn)。HD-Zip家族的轉(zhuǎn)錄因子被分為了四個亞家族:HD-ZipⅠ—Ⅳ。首先，通過Blast搜索和系譜樹分析，我們在黃瓜中找到了13個HD-ZipⅠ類的轉(zhuǎn)錄因子，通過系譜樹分析將這13個轉(zhuǎn)錄因子分成了α，β1，β2

2、，ε，γ和δ6個分支。從HD-ZipⅠ類轉(zhuǎn)錄因子在染色體上的位置可以看出，這些基因不均勻的分布在7條染色體中的5條，染色體位置以及系譜樹的共同分析可以發(fā)現(xiàn)，黃瓜HD-ZipⅠ類轉(zhuǎn)錄因子缺少片段復(fù)制以及串聯(lián)復(fù)制。組織特異性分析實(shí)驗(yàn)顯示出這13個基因最少都能在一個植物器官中被檢測到，表明了黃瓜的HD-ZipⅠ類轉(zhuǎn)錄因子參與了許多細(xì)胞進(jìn)程，并且相同分支內(nèi)的基因表達(dá)位置相似。不同非生物脅迫實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)13個HD-ZipⅠ類轉(zhuǎn)錄因子中的7個響應(yīng)了一個

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