番茄HD-Zip轉錄因子家族生物信息學分析及HD-ZipⅠ亞族抗逆相關基因鑒定分析.pdf

1、隨著番茄種植規(guī)模的不斷擴大，高鹽、干旱、低溫、病原菌等各種非生物和生物脅迫對番茄的生長及生產造成了嚴重的危害。目前為止，大量研究顯示，植物轉錄因子在植物適應和抵御各種非生物及生物脅迫的過程中起著重要的調控作用。近年來對于植物不同轉錄因子家族的研究越來越深入，HD-Zip是植物中特有的一類轉錄因子，參與植物多種生物功能，尤其對植物在非生物脅迫下的應答反應有著重要調控作用。
　　在本研究中，對番茄HD-Zip轉錄因子基因家族進行了生物

2、信息學分析，對番茄HD-Zip蛋白家族的成員進行了分類、理化特性、保守區(qū)、基因結構、染色體分布、二級和三級結構的分析。同時對番茄HD-ZipⅠ亞家族組織特異性及非生物脅迫下的表達模式進行了分析，對應答表現(xiàn)明顯的兩個基因進行了基因沉默分析。為番茄HD-Zip基因家族在非生物脅迫應答過程中的調控功能研究提供理論依據(jù)。主要研究結果如下:
　　鑒定出番茄HD-Zip轉錄因子家族共包含58個成員（SlHZ1-SlHZ58），分為SlHD-Z

3、ipⅠ-Ⅳ亞家族。這些基因不均勻的分布在12條染色體上，番茄HD-Zip基因擴增方式主要為片段復制，家族成員的二級結構主要為螺旋，三級結構具有相似性。
　　對HD-ZipⅠ亞族15個基因進行了組織特異性表達分析，結果顯示，這些成員在根、莖、葉、花以及果實中均有不同程度的表達。大部分基因都能在根中進行表達，而SlHZ30基因僅在花中表達。
　　逆境脅迫表達分析中，在鹽脅迫處理下14個基因表達上調，1個基因（SlHZ14）表達下