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文檔簡介
1、PCR技術的基本原理:該技術是在模板DNA、引物和四種脫氧核糖核苷酸存在下,依賴于DNA聚合酶的酶促合成反應。DNA聚合酶以單鏈DNA為模板,借助一小段雙鏈DNA來啟動合成,通過一個或兩個人工合成的寡核苷酸引物與單鏈DNA模板中的一段互補序列結合,形成部分雙鏈。在適宜的溫度和環(huán)境下,DNA聚合酶將脫氧單核苷酸加到引物3OH末端,并以此為起始點,沿模板5→3方向延伸,合成一條新的DNA互補鏈。PCR目錄〔PCR原理〕PCR反應體系與反應條
2、件〔PCR步驟〕〔PCR檢測〕〔PCR反應特點〕[PCR儀器]聚合酶鏈式反應(PolymeraseChainReaction),簡稱PCR,是一種分子生物學技術,用于放大特定的DNA片段??煽醋魃矬w外的特殊DNA復制。DNA聚合酶(DNApolymeraseI)最早于1955年發(fā)現(xiàn),而較具有實驗價值及實用性的KlenowfragmentofE.Coli則是于70年代的初期由Dr.H.Klenow所發(fā)現(xiàn),但由于此酶不耐高溫,高溫能使之變
3、性因此不符合使用高溫變性的聚合酶鏈式反應?,F(xiàn)今所使用的酶(簡稱Taqpolymerase)則是于1976年從溫泉中的細菌(Thermusaquaticus)分離出來的。它的特性就在于能耐高溫,是一個很理想的酶,但它被廣泛運用則于80年代之后。PCR最初的原始雛形概念是類似基因修復復制,它是于1971年由Dr.KjellKleppe提出。他發(fā)表了第一個單純且短暫性基因復制(類似PCR前兩個周期反應)的實驗。而現(xiàn)今所發(fā)展出來的PCR則于19
4、83由Dr.KaryB.Mullis發(fā)展出的,Dr.Mullis當年服務于PE公司,因此PE公司在PCR界有著特殊的地位。Dr.Mullis并于1985年與Saiki等人正式表了第一篇相關的論文。此后,PCR的運用一日千里,相關的論文發(fā)表質(zhì)量可以說是令眾多其它研究方法難望其項背。隨后PCR技術在生物科研和臨床應用中得以廣泛應用,成為分子生物學研究的最重要技術。Mullis也因此獲得了1993年諾貝爾化學獎。[編輯本段]〔PCR原理〕DN
5、A的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在DNA聚合酶與啟動子的參與下,根據(jù)堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子挎貝。在實驗中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈,當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復性,并設計引物做啟動子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。但是,DNA聚合酶在高溫時會失活,因此,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不僅
6、操作煩瑣,而且價格昂貴,制約了PCR技術的應用和發(fā)展。發(fā)現(xiàn)耐熱DNA聚合同酶Taq酶對于PCR的應用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個循環(huán)加酶,使PCR技術變得非常簡捷、同時也大大降低了成本,PCR技術得以大量應用,并逐步應用于臨床。PCR技術的基本原理類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性退火延伸三個基本反應步驟構成:①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至9
7、3℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;②模板DNA與引物結合(復性)可以在較高的溫度下進行,結合的特異性大大增加,被擴增的靶基因片段也就能保持很高的正確度。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),其特異性程度就更高。靈敏度高PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克(pg=1012)量級的起始待測模板擴增到微克(ug=6)水平。能從100萬個細胞中檢出
8、一個靶細胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位);在細菌學中最小檢出率為3個細菌。簡便、快速PCR反應用耐高溫的TaqDNA聚合酶,一次性地將反應液加好后,即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性退火延伸反應,一般在2~4小時完成擴增反應。擴增產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。對標本的純度要求低不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,DNA粗制品及RNA均可作為擴增模板??芍苯佑门R床標本如血液、體腔液
9、、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活組織等DNA擴增檢測?!睵CR的循環(huán)參數(shù)〕1、預變性(Initialdenaturation)模板DNA完全變性對PCR能否成功至關重要,一般95℃加熱35分鐘。2、引物退火(Primerannealing)退火溫度一般需要憑實驗(經(jīng)驗)決定。退火溫度對PCR的特異性有較大影響。3、引物延伸引物延伸一般在72℃進行(Taq酶最適溫度)。延伸時間隨擴增片段長短而定。4、循環(huán)中的變性步驟循環(huán)中一般95℃,30秒足以使
10、各種靶DNA序列完全變性:變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不徹底,易造成擴增失敗。5、循環(huán)數(shù)大多數(shù)PCR含2535循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴增。6、最后延伸在最后一個循環(huán)后,反應在72℃維持515分鐘使引物延伸完全,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。(四)PCR中的污染和假陽性PCR中污染主要來自1、樣品間交叉污染;2、先前PCR產(chǎn)物遺留(carryover)[編輯本段][PCR儀器]pcr儀器的發(fā)展pcr溫度循環(huán)至關重要,pcr擴增儀各參數(shù)
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