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文檔簡介
1、2008年5月到8月,黃海中部爆發(fā)了大規(guī)模綠潮(滸苔),這是有報道以來世界上最大規(guī)模的綠潮爆發(fā),嚴重影響了海洋生態(tài)系統(tǒng)及人類活動。本文利用細菌16SrRNA基因克隆文庫分析技術研究了大規(guī)模綠潮爆發(fā)期及爆發(fā)后黃海表層海水中微生物群落的多樣性,旨在探索大規(guī)模綠潮爆發(fā)對表層海水中微生物群落的影響,并且為大規(guī)模綠潮爆發(fā)與表層海水中微生物群落之間的相互作用與關系的研究提供有益的線索。
本研究所使用的表層海水樣品通過“北斗”號開放航次
2、分別于2008年7月和8月在黃海的四個站點分別采集獲得。每個站點采集約200L表層海水,使用0.22微米孔徑的微孔濾膜過濾收集菌體,-20℃保存,返回實驗室后保存在-80℃。提取環(huán)境總DNA后用于進行16S rRNA基因的PCR擴增。共成功構建8個16S rRNA基因克隆文庫,選擇限制性酶切圖譜帶型不同的克隆子進行測序及后續(xù)分析。
共獲得228條有效序列,對測序結果進行分析后發(fā)現(xiàn),表層海水中的微生物主要分布于變形菌門(α-
3、,β-,γ-)(Proteobacteria),擬桿菌門(Bacteroidetes),藍細菌門(Cyanobacteria),疣微菌門(Verrucomicrobia),放線菌門(Actinobacteria),浮霉菌門(Planctomycetes)等6個細菌門,8個主要類群,其中的優(yōu)勢類群為α變形菌(33%),γ變形菌(25%),擬桿菌(23%)和藍細菌(9%)。除此之外,還有部分序列目前為止無法確定其系統(tǒng)發(fā)育地位。比較7月和8月
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