醫(yī)學(xué)科研數(shù)據(jù)挖掘方法數(shù)據(jù)分析思路的構(gòu)建與實(shí)例,概要

1、,數(shù)據(jù)分析思路的構(gòu)建與實(shí)例,北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部流行病學(xué)與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系 陳大方 博士/教授/博士生導(dǎo)師電話(huà)：+(010)82802644/18600659288 郵箱：dafangchen@bjmu.edu.cn,不怕做不到，就怕想不到,如何基于數(shù)據(jù)挖掘產(chǎn)生文章思路？,觀察結(jié)局(因變量)研究因素(自變量)混雜因素(協(xié)變量）連續(xù)變量、分類(lèi)變量（二分類(lèi)，等級(jí)變量、無(wú)序變量）環(huán)境因素、臨床指標(biāo)、遺傳易

2、感性(基因多態(tài)性)……,思考點(diǎn)從研究變量之間關(guān)系角度思考從研究對(duì)象構(gòu)成的角度思考從研究的時(shí)間角度思考從以上兩個(gè)或以上思考,芳香烴有機(jī)溶劑暴露對(duì)女性生殖結(jié)局的影響研究(NIH Project 1996——2000),數(shù)據(jù)挖掘?qū)嵗?課題研究背景 芳香烴類(lèi)有機(jī)溶劑在環(huán)境中普遍存在，是一種潛在的生殖毒物，主要包括苯、甲苯、二甲苯、苯乙稀等。它在高濃度下對(duì)健康所產(chǎn)生的危害已為國(guó)內(nèi)外較多研究所證實(shí)。但是，女性長(zhǎng)期

3、暴露于低濃度芳香烴有機(jī)溶劑對(duì)生殖結(jié)局的影響研究報(bào)道較少。,研究目的了解石油石化工冶煉廠女工芳香烴有機(jī)溶劑等職業(yè)有害因素的暴露情況。探討職業(yè)、環(huán)境因素暴露，遺傳易感性與女性生殖結(jié)局的關(guān)系。,問(wèn)卷調(diào)查臨床體檢,,,,,,,,,,,,,,,,,新婚體檢,停止避孕,,,,,,分娩,,妊娠,新婚隨訪,新婚日記每日晨尿,暴露評(píng)價(jià),孕期隨訪問(wèn)卷調(diào)查,出生記錄,生活習(xí)慣,一般健康狀況,疾病史,膳食營(yíng)養(yǎng),月經(jīng)情況,家庭居住,血清營(yíng)養(yǎng),暴露

4、評(píng)價(jià),β-hcg檢測(cè),遺傳易感性,早孕隨訪,中孕隨訪,基線(xiàn)隨訪,分娩住院記錄,研究?jī)?nèi)容,I相代謝酶基因和II相代謝酶基因，共12個(gè)基因多態(tài)性位點(diǎn),職業(yè)情況膳食營(yíng)養(yǎng)月經(jīng)情況家庭居住情況其他,血紅蛋白鐵維生素B6維生素B12葉酸鐵蛋白轉(zhuǎn)鐵蛋白受體同型半胱氨酸,監(jiān)測(cè)車(chē)間內(nèi)芳香烴有機(jī)溶劑濃度個(gè)體主動(dòng)采樣泵采樣暴露評(píng)價(jià)問(wèn)卷上班時(shí)活動(dòng)情況,2.研究對(duì)象 (記錄)1600對(duì)在燕山石化工作的新婚體檢對(duì)象：芳香烴有機(jī)溶劑

5、暴露組800對(duì)非暴露組800對(duì),3. 研究設(shè)計(jì) (時(shí)間)前瞻性隊(duì)列研究設(shè)計(jì)（新婚體檢---臨床分娩或一年）,文章思路構(gòu)建步驟,,,觀察結(jié)局,,一般人口學(xué)特征，如年齡、性別、職業(yè)疾病史芳香烴有機(jī)溶劑暴露，如笨、二甲苯等職業(yè)因素，如倒班、噪聲、工作體位生活行為，如吸煙、飲酒等膳食營(yíng)養(yǎng)體格檢查，如身高、體重、血壓臨床生化檢查：如肝腎功能血清營(yíng)養(yǎng)素，如維生素B6，B12，葉酸、鐵蛋白，轉(zhuǎn)鐵蛋白受體尿液檢測(cè)，如β-hcg

6、遺傳易感性，如CYP、GST,,研究因素/混雜,,,出生結(jié)局，如出生體重、孕周 受孕時(shí)間早早孕丟失臨床懷孕 月經(jīng)功能，如月經(jīng)周期、痛經(jīng),,一般人口學(xué)特征，如年齡、性別、職業(yè)疾病史芳香烴有機(jī)溶劑暴露，如笨、二甲苯等職業(yè)因素，如倒班、噪聲、工作體位生活行為，如吸煙、飲酒等膳食營(yíng)養(yǎng)體格檢查，如身高、體重、血壓臨床生化檢查：如肝腎功能血清營(yíng)養(yǎng)素，如維生素B6，B12，葉酸、鐵蛋白，轉(zhuǎn)鐵蛋白受體尿液檢測(cè)，如β-hcg

7、遺傳易感性，如CYP、GST,,出生結(jié)局，如出生體重、孕周 受孕時(shí)間早早孕丟失臨床懷孕 月經(jīng)功能，如月經(jīng)周期、痛經(jīng),數(shù)據(jù)預(yù)處理數(shù)據(jù)描述單因素分析,孕婦混苯化合物暴露對(duì)胎兒生長(zhǎng)發(fā)育的影響。被動(dòng)吸煙對(duì)女性月經(jīng)功能影響研究。北京某石油化工廠女工苯的內(nèi)暴露研究。芳香烴和母親某些代謝酶基因多態(tài)性對(duì)新生兒出生身長(zhǎng)的影響微粒體環(huán)氧化酶與谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶的遺傳多態(tài)性對(duì)新生兒出生體重的影響.早孕期低濃度苯系物暴露對(duì)胎兒身長(zhǎng)的影響。

8、低濃度混苯對(duì)女工生殖激素分泌的影響。新生兒PON2基因多態(tài)性與早產(chǎn)的關(guān)系。 輪班作業(yè)女工排卵日前后的夜班次數(shù)對(duì)妊娠結(jié)局的影響。工效學(xué)因素對(duì)婦女臨床受孕時(shí)間影響的研究。以尿激素標(biāo)記物探討職業(yè)噪聲暴露與紡織女工月經(jīng)功能的關(guān)系?！?結(jié)果是文章的核心結(jié)果的順序絕不是按獲得數(shù)據(jù)的先后排列，而是要按企圖說(shuō)明問(wèn)題的邏輯順序排列；不要羅列結(jié)果，要分析，結(jié)果之間要有邏輯聯(lián)系；,P5,,,被動(dòng)吸煙,受孕時(shí)間,早早孕丟失,有機(jī)溶劑暴露,孕前

9、營(yíng)養(yǎng),身高體重指數(shù),職業(yè)因素暴露,臨床懷孕,遺傳易感性,早產(chǎn),月經(jīng)周期,痛經(jīng),出生體重,新生兒身長(zhǎng)、頭圍胎兒宮內(nèi)生長(zhǎng)發(fā)育遲緩旁氏指數(shù),P12,被動(dòng)吸煙,受孕時(shí)間,早早孕丟失,有機(jī)溶劑暴露,孕前營(yíng)養(yǎng),身高體重指數(shù),職業(yè)因素暴露,臨床懷孕,遺傳易感性,早產(chǎn),月經(jīng)周期,痛經(jīng),出生體重,新生兒身長(zhǎng)、頭圍胎兒宮內(nèi)生長(zhǎng)發(fā)育遲緩旁氏指數(shù),,P4,,P15,,p13,,P5,,P12,P14,,陳大方,劉彤杉,王黎華,黃因敏,趙一鳴,

10、徐希平. 孕婦混苯化合物暴露對(duì)胎兒生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J]. 疾病控制雜志,1997,04:263-266.陳大方,劉彤杉,楊萍,王黎華,黃因敏,趙一鳴,徐希平. 環(huán)境與職業(yè)因素對(duì)胎兒生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J]. 環(huán)境與健康雜志,1998,03:6-8.潘小川,丁輝,韓麗力,王黎華,徐希平. 被動(dòng)吸煙對(duì)女性月經(jīng)功能影響研究[J]. 衛(wèi)生研究,1999,01:25-27.朱蘭,潘小川,昊昆昱,池頻頻,王黎華,徐希平. 北京某石油化工廠女工苯的

11、內(nèi)暴露研究[J]. 中國(guó)公共衛(wèi)生,1999,10:53-54.陳大方,王曉斌,王朝曦,王黎華,徐希平. 芳香烴和母親某些代謝酶基因多態(tài)性對(duì)新生兒出生身長(zhǎng)的影響[J]. 北京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2000,05:450-454.陳大方,王朝曦,王曉斌,王黎華,徐希平. 微粒體環(huán)氧化酶與谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶的遺傳多態(tài)性對(duì)新生兒出生體重的影響[J]. 環(huán)境與健康雜志,2000,03:131-134.陳大方,趙一鳴,臧桐華,王黎華,徐希平. 早孕期低

12、濃度苯系物暴露對(duì)胎兒身長(zhǎng)的影響[J]. 疾病控制雜志,2000,02:120-122.陳大方,王曉斌,吳迪,王黎華,徐希平. 細(xì)胞色素P450氧化酶MSP1基因?qū)τ袡C(jī)溶劑的易感性與新生兒出生體重的影響[J]. 環(huán)境與健康雜志,2001,04:208-211.,發(fā)表在中華核心期刊文章,陳海燕,王心如,徐莉春,Lasley BL,Overstreet JW,戴建國(guó),張綺,邢厚恂,杜冰,徐希平. 低濃度混苯對(duì)女工生殖激素分泌的影響[J].

13、中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志,2001,02:12-15.王守林,陳宇煉,陳海燕,徐莉春,曹晉柱,杜冰,王頂賢,施愛(ài)民,徐希平,王心如. 某石化企業(yè)和化纖企業(yè)女工不良妊娠結(jié)局的危險(xiǎn)因素分析[J]. 工業(yè)衛(wèi)生與職業(yè)病,2001,03:140-143.梁紅業(yè),吳白燕,陳大方,陳櫟,徐希平,楊帆,胡海燕. 新生兒PON2基因多態(tài)性與早產(chǎn)的關(guān)系[J]. 遺傳,2002,05:515-518.李佩芝,方自國(guó),潘小川,王黎華,徐希平. 輪班作業(yè)女工排卵日

14、前后的夜班次數(shù)對(duì)妊娠結(jié)局的影響[J]. 中華勞動(dòng)衛(wèi)生職業(yè)病雜志,2002,05:52-54.吳白燕,梁紅業(yè),陳大方,劉林,楊帆,胡海燕,陳櫟,王桂香,徐希平. 新生兒CYP2E1基因5′端RsaⅠ位點(diǎn)多態(tài)性和PON2基因148位點(diǎn)多態(tài)性與早產(chǎn)的關(guān)系[J]. 遺傳學(xué)報(bào),2003,06:577-583.游良雅,潘小川,陳大方,張金良,黃因敏,徐希平,夏桂芳. 苯系混合物對(duì)新婚女工生育功能的影響[J]. 中國(guó)公共衛(wèi)生,2003,07:10

15、9-110.倪佳桐,黃愛(ài)群,楊帆,劉學(xué),徐希平. 工效學(xué)因素對(duì)婦女臨床受孕時(shí)間影響的研究[J]. 疾病控制雜志,2003,05:420-422.李佩芝,潘小川,徐希平,王黎華. 以尿激素標(biāo)記物探討職業(yè)噪聲暴露與紡織女工月經(jīng)功能的關(guān)系[J]. 工業(yè)衛(wèi)生與職業(yè)病,2004,03:130-135.,Li S, Fang K, Wang W, Hu Y, Chen D. Gene-environment Interaction among

16、GSTT1, PON2 Polymorphisms and Organic Solvents on Gestational Age in a Chinese Women Cohort. Journal of Assisted Reproduction and Genetics. 2014.31(7):881-888.Ting Wu, Yonghua Hu, Changzhong Chen,Fan Yang, Zhiping Li, Z

17、hian Fang, Lihua Wang, Dafang Chen. Passive smoking, metabolic gene polymorphism and infant birth weight in a prospective cohort of Chinese women. Am J Epidemiol 2007: 166(3):313-322.Xueying Qin, Yiqun Wu, Changzhong

18、Chen, Fan Yang, Zhiping Li, Zhian Fang, Lihua Wang, Yonghua Hu, Dafang Chen. Low organic solvent exposure and combined maternal-infant gene polymorphisms affect gestational age. Occupational and Environmental Medicine,

19、 2008;65(7):482-487.Na Li, Hong Liu, Yonghua Hu, Changzhong Chen,Fan Yang, Zhiping Li, Zhian Fang, Lihua Wang, Dafang Chen. CYP1A1 gene polymorphisms in modifying association between Passive smoking and primary dysmen

20、orrheal. Annals of Epidemiology. 2007：17（11）：882-888.,發(fā)表在SCI期刊文章,Xiaobin Wang, Dafang Chen et al, Genetic Susceptibility to Benzene and Shortened Gestation: Evidence of Gene-Environment Interaction. American Journal of

21、Epidemicology 2000;152(8):693-700. Dafang Chen, Xiaobin Wang, Changzhong Chen, et al. Exposure to benzene, occupational stress, and reduced birth weight. Occup Environ Med. 2000;57(10):661-667.Alayne G. R., Goldman M.

22、B., Dafang Chen, et al. Preconception homocysteine and B-vitamin status and birth outcomes in Chinese women. American Journal of Clinical Nutrition, 2002; 76(6):1385-1391.Venners SA, Wang X, Chen C, Wang L, Chen D, et a

23、l. Paternal Smoking and Pregnancy Loss: A Prospective Study Using a Biomarker of Pregnancy. Am J Epidemiol 2004: 159(10) 993-1001.Ronnenberg AG, Wang X, Xing H, Chen C, Chen D, et al. Low Preconception Body Mass Index

24、Is Associated with Birth Outcome in a Prospective Cohort of Chinese Women. J. Nutr. 2003; 133:3449-3455.Wang X, Chen C, Wang L, Chen D, et al. Conception, Early Pregnancy Loss, and Time to Clinical Pregnancy: A Populati

25、on-Based Study. Fertility & Sterility. 2003; 79(3):577-584.,Ha E, Cho SI, Park H, Chen D et al. Does standing at work during pregnancy result in reduced infant birth weight? Occup Environ Med 2002 ;44(9):815-21.Eunh

26、ee Ha,  Sung-il Cho,  Dafang Chen et al,  Parental exposure to organic solvents and reduced birth weight. Archives of Environmental Health, 2002;57(3):207-212.Chen C, Wang X, Chen D, et al. Tofu Cons

27、umption and Blood Lead Levels in Young Chinese Adults. Am J Epidemiol 2001;153(12) : 1206-1212.Sung-Il Cho, Andrew I. Damokosh, Louise M. Ryan, Dafang Chen, et al. Effects of Exposure to Organic Solvents on Menstrual C

28、ycle Length. J Occup Environ Med 2001 ;43(6):567-561Chen C, Cho S, Damokosh A, Chen D, et al Prospective Study of Exposure to Environmental Tobacco Smoke and Dysmenorrhea. Environmental Health Perspectives. November 200

29、0; 108(11):1019-22. Ronnenberg AG, Wood RJ, Wang X, Xing H, Chen C, Chen D, et al. Preconception Hemoglobin and Ferritin Concentrations Are Associated with Pregnancy Outcome in a Prospective Cohort of Chinese Women. J N