豬GSTM2，TGF-β1基因的多態(tài)性及與生產性狀相關性分析.pdf

1、母豬產仔性狀是評價豬場效益的重要指標，也是豬育種工作的重點。谷胱甘肽-硫-轉移酶mu亞基基因（glutathione S-transferase Mu2，GSTM2）和轉化生長因子β1（transfonminggrowth factor beta type one，TGF-B1）基因是與母豬生殖系統(tǒng)免疫和生長發(fā)育有關的基因。分析GSTM2基因和TGF-β1基因的多態(tài)性，并與生產性狀進行相關性分析，可以檢測GSTM2基因和TGF-β1基因

2、的單堿基改變對母豬生產性狀的影響，通過合并基因型的方法，可以同時檢測兩個基因的不同多態(tài)位點對生產性狀的影響。本研究以野豬、民豬、北京黑豬豬、長白豬和法系大白為實驗材料，克隆野豬基因的全長編碼區(qū)序列；用生物信息學的方法對其結構功能域及分子進化進行分析；采用PCR-SSCP的方法分析GSTM2基因和TGF-β1基因的單核苷酸多態(tài)性，檢測了不同等位基因在豬種中的分布規(guī)律；分析了每個多態(tài)位點對母豬繁殖性狀的影響，并利用最小二乘法估算了合并基因型

3、對母豬繁殖性狀的影響。獲得的主要研究結果如下：
　　 1獲得了野豬的GSTM2基因的全長編碼區(qū)序列，序列全長683bp，編碼188個氨基酸。同時獲得野豬的TGF-β1基因的全長編碼序列，序列全長1172bp，編碼390個氨基酸。采用生物信息學方法對其編碼的多肽鏈進行了結構和功能域的初步分析，GSTM2編碼蛋白的功能域中含有2個結構蛋白：GST-NTER和GST-CTER。TGF-β1編碼蛋白的功能域中含有多個功能結構：EGF-1

4、，2FE2S-FER-1，VWFC-1，ANAPHYLATOXIN-1，CTCK-1，DEFENSIN，4FE4S-FER-1，INTEGRIN-BETA。
　　 2 PCR-SSCP分析發(fā)現(xiàn)，在GSTM2基因中內含子存在3個單核苷酸突變：370G→370A，2395C→2395T，2406A→2406G。外顯子中存在9個單核苷酸突變，其中5個：390G→390A，884G→884C，929G→929A，1274G→1274A，

5、1289A→1289G屬于同義突變。4個：1435T→1435C，2290A→2290C，2466C→2466A.2486A→2486T屬于錯義突變。TGF-β1基因中發(fā)現(xiàn)2個內含子單核苷酸突變，第四內含子33bpC→T和第六內含子179bpA→G處。
　　 3基因多態(tài)單點分析表明，GSTM2基因中G2位點的AB型總產仔數(shù)最高、G5位點的AB型總產仔數(shù)最高、G7位點的AB型總產仔數(shù)最高，這三個位點的突變對母豬生產性狀的影響極顯著