棉花TRIPTYCHON基因的電子克隆和功能初步驗(yàn)證.pdf

1、棉花纖維的長度是評(píng)價(jià)棉花纖維內(nèi)在品質(zhì)的一個(gè)很重要的指標(biāo)，同時(shí)單粒籽棉的棉花纖維數(shù)量直接影響棉花皮棉產(chǎn)量。
　　 研究表明，植物表皮細(xì)胞的發(fā)育受多個(gè)基因調(diào)控，表皮細(xì)胞的發(fā)育在不同植物中具有相似的基因調(diào)控模式。棉花纖維是胚珠外珠被表皮細(xì)胞發(fā)育延伸而成的表皮毛，棉花纖維細(xì)胞的發(fā)育與擬南芥表皮毛發(fā)育模式相似。擬南芥中存在GLABROUS1（GL1）、GLABRA2（GL2）、GLABRA3（GL3）、TRANSPARENT TESTA

2、GLABRA1（TTG1）、TRANSPARENT TESTA GLABRA2（TTG2）等基因促進(jìn)擬南芥表皮毛的發(fā)育，同時(shí)又存在TRIPTYCHON（TRY）和CAPRICE（CPC）基因抑制擬南芥表皮毛的發(fā)育。前人研究報(bào)道，棉花中也存在TTG1、GL1、GL2等同源基因促進(jìn)棉纖維的發(fā)育，但是棉花中尚未報(bào)道是否存在抑制棉花纖維發(fā)育的與TRY和CPC同源基因。
　　 本研究利用電子克隆和RT-PCR相結(jié)合的方法從徐州142無絨無

3、絮突變體棉花中克隆到棉花TRY基因。經(jīng)過RT-PCR克隆后測(cè)序，棉花TRY基因ORF（Open read frame）全長270bp，編碼89個(gè)氨基酸，其蛋白質(zhì)由18種氨基酸組成，其基因?qū)崪y(cè)序列的ORF堿基序列與電子克隆的ORF的堿基序列僅有一個(gè)位點(diǎn)的差異，各自的ORF翻譯為蛋白后，其氨基酸序列僅有一個(gè)位點(diǎn)的差異，表明電子克隆所得基因序列具有很強(qiáng)的真實(shí)性。
　　 利用生物信息學(xué)分析，該蛋白分子量為10638.1 Da；理論等電點(diǎn)

4、pI：8.66；原子組成是C461H734N140O136S7；消光系數(shù)280nm ：19605；不穩(wěn)定系數(shù)是75.26；脂肪系數(shù)是61.35；總平均親水性為-0.899。同擬南芥TRY蛋白一樣，不存在信號(hào)肽、糖基化位點(diǎn)、跨膜結(jié)構(gòu)、卷曲螺旋結(jié)構(gòu)。同擬南芥TRY蛋白一樣定位于細(xì)胞核中，同屬于不穩(wěn)定、疏水性蛋白，MYB類轉(zhuǎn)錄因子。功能預(yù)測(cè)表明，棉花TRY基因編碼的蛋白在細(xì)胞內(nèi)部將執(zhí)行同擬南芥TRY基因編碼的蛋白相似的功能。
　　 將