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文檔簡(jiǎn)介
1、太湖稻區(qū)歷史悠久,積累了豐富的水稻地方品種資源。研究地方品種資源的遺傳多樣性可為優(yōu)質(zhì)資源的保護(hù)和利用以及新品種的選育提供一些參考。本研究一方面以太湖地區(qū)549份水稻地方品種為供試材料,選用23個(gè)與淀粉合成相關(guān)的基因內(nèi)分子標(biāo)記對(duì)其淀粉品質(zhì)基因型進(jìn)行檢測(cè),分析太湖地區(qū)地方品種中的品質(zhì)基因多樣性,整理出地方品種中所包含的淀粉相關(guān)基因的基因型,并與來(lái)源廣泛的92份現(xiàn)代育成品種進(jìn)行比較研究。另一方面選用48個(gè)均勻分布于水稻全基因組的SSR標(biāo)記對(duì)依
2、據(jù)品質(zhì)基因型差異選出的314份地方品種進(jìn)行掃描,明確太湖地區(qū)水稻地方品種的群體結(jié)構(gòu)和分化,并基于群體結(jié)構(gòu)進(jìn)行部分淀粉品質(zhì)性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析。研究結(jié)果如下:
(1)23個(gè)與淀粉合成相關(guān)的基因內(nèi)分子標(biāo)記在549份水稻地方品種中一共檢測(cè)到53個(gè)等位基因,平均每個(gè)基因位點(diǎn)檢測(cè)到2.94個(gè)等位基因。地方品種基因多樣性平均為0.2104,變幅為0.0109~0.6476;平均PIC值為0.1847,變幅為0.0108~0.58
3、64。而在育成品種中,共檢測(cè)到46個(gè)等位基因,平均每個(gè)基因位點(diǎn)檢測(cè)到2.56個(gè)等位基因。育成品種的基因多樣性平均為0.1749,變幅為0.0430~0.5286;平均PIC值為0.1538,變幅為0.0421~0.4199。
(2)將所測(cè)與淀粉合成相關(guān)基因位點(diǎn)的等位基因進(jìn)行組合,549份水稻地方品種一共整理出107種基因型,其中有65種基因型只有1個(gè)品種與之對(duì)應(yīng),其他基因型都包含幾個(gè)甚至幾十個(gè)品種。92份育成品種共整理出3
4、2種基因型,但只有3種基因型出現(xiàn)在地方品種中。糊化溫度和膠稠度在基因型間都存在著極顯著的差異。
(3)48對(duì)SSR引物在314份水稻地方品種中共檢測(cè)到257個(gè)等位變異,平均每個(gè)位點(diǎn)檢測(cè)到5.35個(gè)等位變異,變幅為2~13個(gè)。其中在30個(gè)位點(diǎn)上檢測(cè)到稀有等位變異(頻率低于1%)41個(gè),占全部等位變異數(shù)的16.0%。SSR水平的多樣性平均為0.3869,變幅為0.0063~0.8806;平均PIC值為0.3637,變幅為0.0
5、063~0.8688。
(4)通過(guò)群體結(jié)構(gòu)分析,314份水稻地方品種可分為5個(gè)亞群。48個(gè)SSR位點(diǎn)的1128種位點(diǎn)組合中,統(tǒng)計(jì)概率(P<0.001)支持的不平衡成對(duì)位點(diǎn)組合數(shù)占總位點(diǎn)組合數(shù)的92.6%,不平衡程度D>0.5的組合數(shù)占總位點(diǎn)組合數(shù)的67.0%。對(duì)于整個(gè)群體,LD在遺傳距離<150cM普遍存在。
(5)基于群體結(jié)構(gòu)的關(guān)聯(lián)分析共檢測(cè)出21個(gè)SSR位點(diǎn)與兩個(gè)淀粉品質(zhì)性狀顯著關(guān)聯(lián)。其中,與糊化溫度顯著
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