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文檔簡介
1、以香菇(Lentinula edodes)的兩個栽培品種武香1號和L205各自的單孢W26和L6進(jìn)行雜交(W26×L6),獲得的146個單孢作為遺傳分離群體。運用SSR、Indel、CAPS分子標(biāo)記對香菇遺傳分離群體進(jìn)行PCR擴增分析:從151對SSR引物中篩選得到38對具有多態(tài)性條帶的引物;在38對Indel引物中篩選得到17對具有較高多態(tài)性條帶的引物;在83對CAPS引物中,則僅有1對引物具有較高的多態(tài)性。
將本研究中
2、篩選得到的56對引物,對本實驗室前期構(gòu)建的分子遺傳連鎖圖進(jìn)行標(biāo)記加密。利用Joinmap作圖軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,構(gòu)建了一個包含有571個標(biāo)記,11個連鎖群的香菇分子遺傳連鎖圖譜。圖譜總長度為967 cM,連鎖群的大小在22cM~233 cM之間,平均大小為87.9 cM;標(biāo)記間的距離在0~21 cM,標(biāo)記間的平均距離為1.87 cM。本實驗中篩選到有10個分子標(biāo)記定位到連鎖群中,其中SSR分子標(biāo)記僅有一個,其余9個為Indel分子標(biāo)記,其
3、余46個分子標(biāo)記則有可能位于端?;蛑z粒位置。本實驗所構(gòu)架的香菇高密度分子遺傳連鎖圖譜在2 cM、5 cM、10 cM以內(nèi),一個標(biāo)記的覆蓋度分別為80.1%、98.2%、99.9%。
利用上述圖譜對香菇漆酶活性進(jìn)行QTL定位研究。結(jié)果表明,與香菇單核體漆酶酶活性相關(guān)的QTL共有7個,其中漆酶酶活性總平均值定位到兩個QTL為qLac1和qLac2。qLac1位于LG3中約49.6 cM處,貢獻(xiàn)率為9.21%;qLac2位于L
4、G6中約42.4 cM處,貢獻(xiàn)率為8.95%。這兩個QTL均具有負(fù)的加性效應(yīng),總貢獻(xiàn)率為18.16%。第5d的漆酶活性值定位到兩個QTL位為qLac5-1和qLac5-2。qLac5-1位于LG6中約40.6 cM處,貢獻(xiàn)率為9.73%;qLac5-2則位于LG6中約48.4 cM處,貢獻(xiàn)率為9.04%。這兩個QTL均具有負(fù)的加性效應(yīng),總貢獻(xiàn)率為18.77%。第15d的漆酶活性值定位到一個QTL qLac15-1。qLac15-1位于L
5、G7中約43.4 cM處,具有正的加性效應(yīng),貢獻(xiàn)率為11.51%。第20 d的漆酶活性值定位到兩個QTL為qLac20-1和qLac20-2.qLac20-1位于LG7中約35.0 cM處,具有正的加性效應(yīng),貢獻(xiàn)率為65.53%;qLac20-2則位于LG7中約57.7 cM處,該QTL具有負(fù)的加性效應(yīng),貢獻(xiàn)率為17.63%。
利用SSR,Indel,CAPS分子標(biāo)記對香菇分子遺傳圖譜進(jìn)行了加密,獲得了高密度分子遺傳連鎖圖
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