玉米苗期SR和hnRNP基因家族的干旱脅迫應(yīng)答.pdf

1、選擇性剪接作為一種高等真核生物重要的基因表達(dá)調(diào)控方式，能夠影響轉(zhuǎn)錄本的組分及其相對(duì)表達(dá)豐度，而SR蛋白(serine/arginine-richproteins)和hnRNP蛋白(heterogeneousnuclearRNPproteins)是關(guān)鍵的剪接因子。我們利用生物信息學(xué)方法與手段，研究玉米剪接因子的分子生物學(xué)特性及其進(jìn)化關(guān)系。研究剪接因子與干旱脅迫的關(guān)系，為玉米抗旱育提供種理論依據(jù)和基因材料。主要研究結(jié)果如下:
　　1、

2、對(duì)研究的hnRNP蛋白家族的42個(gè)成員，在10條染色體上是均有分布:在1和8號(hào)染色體上分別都有4個(gè)成員分布，2、3、4和7號(hào)染色體上分別有6個(gè)成員分布，在5號(hào)染色體上有5個(gè)成員分布，在6號(hào)染色體上有3個(gè)成員分布，9號(hào)和10號(hào)染色上都只有一個(gè)。分子量在15427-88734KDa之間，氨基酸長(zhǎng)度介于155和794之間，其中有27個(gè)基因成員的蛋白質(zhì)等電點(diǎn)為堿性(PH7.11～pH9.66)，而剩余的15個(gè)成員的蛋白質(zhì)等電點(diǎn)是酸性(pH4.7

3、-pH6.58)。
　　2、對(duì)研究的hnRNP蛋白家族成員基于RRM保守結(jié)構(gòu)域構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，由于42個(gè)成員中有6個(gè)成員的N(')端是沒(méi)有RRM識(shí)別基序的，取其位于N'端的第一個(gè)RRM結(jié)構(gòu)進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析。36個(gè)玉米hnRNP蛋白基因家族成員劃分為6個(gè)亞組。
　　3、對(duì)選取的hnRNP蛋白家族的42個(gè)成員做啟動(dòng)子順式調(diào)控元件分析，結(jié)果顯示:42個(gè)hnRNP蛋白基因的啟動(dòng)子區(qū)域中除了核心啟動(dòng)子元件(CAAT-Box，TATA

4、-Box)外，含有3～8種與發(fā)育、植物激素和脅迫響應(yīng)相關(guān)的順式調(diào)控元件。
　　4、選取30個(gè)hnRNP蛋白基因的做表達(dá)譜分析表明:在H21中，HnRNP蛋白基因家族在干旱脅迫條件下整體調(diào)控模式以下調(diào)表達(dá)為主;對(duì)玉米遺傳材料掖478而言，在干旱脅迫條件下HnRNP家族基因成員上調(diào)表達(dá)為主。
　　5、以鄭58、昌7-2和鄭單958三種遺傳材料為實(shí)驗(yàn)材料，做植物葉片的相對(duì)含水量分析。結(jié)果表明:鄭單958在水分脅迫下RWC變化最小，