水稻強(qiáng)分蘗基因stl的分子定位研究.pdf

1、該研究從粳稻(Oryza sativa Lsubsp.japonica)中花11號(hào)經(jīng)0.1％EMS處理的后代中獲得一份強(qiáng)分蘗突變體材料"多蘗",其最顯著生長(zhǎng)特征是分蘗速度快,分蘗旺盛,莖蘗細(xì)而多,葉片細(xì)長(zhǎng),矮生.以突變體多蘗為母本與Dular進(jìn)行雜交,獲得雜交F<,1>及F<,2>.對(duì)它們的莖蘗數(shù)進(jìn)行系統(tǒng)調(diào)查發(fā)現(xiàn),F<,1>代表現(xiàn)為正常分蘗,F<,2>代分蘗性狀發(fā)生分離,F<,2>代群體共調(diào)查738株,其莖蘗數(shù)次數(shù)分布表現(xiàn)為連續(xù)變異的雙

2、峰分布,且兩峰值分別與兩親本的莖蘗數(shù)相近,以兩峰之間的最低值為界限進(jìn)行分組,形成正常分蘗株(1~39個(gè)/株)和強(qiáng)分蘗株(39~72個(gè)/株)兩個(gè)集團(tuán),其中莖蘗數(shù)為39~72個(gè)的有170株;莖蘗數(shù)為1~39個(gè)的有568株.正常株與強(qiáng)分蘗株的比例符合1對(duì)基因的分離比例3:1(χ<,c><'2>=1.4164<χ<,0.05,1><'2>=3.84),說(shuō)明強(qiáng)分蘗突變性狀受1對(duì)隱性基因控制.利用多蘗與Dular雜交產(chǎn)生的F<,2>群體對(duì)此強(qiáng)分蘗性

3、狀的隱性基因進(jìn)行了精細(xì)定位.該基因首先被定位在水稻第1染色體上微衛(wèi)星標(biāo)記SSR149和RM297之間,遺傳距離分別是0.80cM,3.10cM.對(duì)照已有的連鎖圖,可以推斷出強(qiáng)分蘗基因stl位于水稻第1染色體長(zhǎng)臂的中下部,文獻(xiàn)檢索結(jié)果發(fā)現(xiàn),第1染色體此位置上沒(méi)有類似的基因,表明該基因?yàn)橐恍聫?qiáng)分蘗基因,將該基因暫定名為stl(strongtillering).為了進(jìn)一步定位stl基因,利用已經(jīng)公布的水稻基因組序列在stl基因附近區(qū)域?qū)ふ椅⑿l(wèi)

4、星序列并發(fā)展新的標(biāo)記,在RM297和SSR149之間發(fā)展了4個(gè)有多態(tài)的微衛(wèi)星標(biāo)記SSR-1-27、SSR-1-24、SSR-st3和SSR-st4,以及初步定位表現(xiàn)為共分離的SSR261、SSR227對(duì)精細(xì)定位群體進(jìn)行檢測(cè)后發(fā)現(xiàn),stl位于SSR-1-27與SSR261之間,與前者相距0.30cM,與后者約距0.05cM,而與SSR-1-24、SSR-st3、SSR-st4表現(xiàn)為共分離.以此為基礎(chǔ),構(gòu)建了覆蓋stl基因區(qū)域的BAC重疊群