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文檔簡介
1、中圖分類號理311：墨UDC魚至Q碩士學位論文學校代碼!Q5呈曼密級公玨人參皂苷轉(zhuǎn)運相關基因PgPDR2的生物信息學分析與意義BioinformaticsanalysisandsignificanceofginsenosidetransportrelatedgenePgPDR2作者姓名：學科專業(yè)：研究方向：學院(系、所)：指導教師：羅俊軟件工程生物醫(yī)學信息技術軟件學院羅志勇教授論文答辯日期塑!至型：呈≯答辯委員會主席蘭l圭竺_中南大學二
2、零一三年十一月人參皂苷轉(zhuǎn)運相關基因PgPDR2的生物信息學分析與意義摘要：ATP結合盒(ATP—bindingcassette，ABC)轉(zhuǎn)運蛋白是目前已知最大、功能最廣泛的轉(zhuǎn)運蛋白家族。多向耐藥性(pleiotropicdrugresistance，PDR)蛋白是該家族中僅存于植物和真菌中的一個亞族。該基因家族可能通過水解ATP釋放能量，引起蛋白質(zhì)構象變化，參與包括人參皂苷在內(nèi)的植物次生代謝產(chǎn)物的跨膜轉(zhuǎn)運及脅迫反應等功能。該論文在前期克
3、隆到人參PgPDR2基因全長cDNA基礎上，選擇應用生物信息學分析計算機軟件，解析及預測該基因及編碼蛋白質(zhì)結構與功能。基于GenBank核酸數(shù)據(jù)庫進行同源性比較、構建系統(tǒng)發(fā)育進化樹、解析PgPDR2氨基酸化學組成、理化性質(zhì)、二級結構、三級結構。結果表明，人參PgPDR2基因與植物PDR基因具有較高的同源性。人參P妒DR2蛋白穩(wěn)定，無信號肽，含有兩個跨膜結構域，含有磷酸化位點，定位于細胞膜上，保守區(qū)域包含ATP結合位點、ABC標記(ABC
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