中國七個地方綿羊品種微衛(wèi)星DNA的遺傳多樣性研究.pdf

1、摘要1中國七個地方綿羊品種微衛(wèi)星DNA的遺傳多樣性研究摘要根據項目任務要求，本研究利用微衛(wèi)星標記技術，對我國的7個地方綿羊品種:湖羊、哈薩克羊、巴音布魯克羊、阿勒泰羊、黑藏羊、白藏羊和晉中羊的遺傳多樣性進行研究，探討了它們之間群體內、群體間的遺傳變異。研究結果如下:1.在28個微衛(wèi)星位點中，共檢測到286個等位基因，平均每個位點為10.6個。其中以AGLA269位點檢測到的等位基因數目最多，為18個其次是BM4311位點，為15個等位基

2、因。等位基因數目最少的位點為BM315.ILSTS021位點，分別檢測到4個等位基因。2.運用軟件對受試羊進行優(yōu)勢等位基因和稀有等位基因分析，結果表明:28個微衛(wèi)星位點都有優(yōu)勢等位基因存在。有11個位點檢測到稀有等位基因.3.以等位基因頻率為基礎，得出位點的平均雜合度在0.0629.0.5903之間，群體平均雜合度在0.3421^0.4215之間，屬于中度雜合群體和中度雜合位點。根據統(tǒng)計結果除BM315.ILSTS021的PIC0.5之

3、外，其余26個位點均為高度多態(tài)位點。在26個高度多態(tài)位點中，0.60PIC.0.70的共有4個位點，占到15.38%0.70PIC0.80的共有13個位點，占到50.00%0.80PIC0.90的共有9個，占到34.62%。在26個高度多態(tài)位點中，以AGLA269位點的多態(tài)信息含量最高，達到0.8712ILSTS021位點的多態(tài)信息含量最小。為0.3453。在7個品種中，湖羊的多態(tài)信息含量最高，為0.7590哈薩克羊的最低，為0.731

4、704.對受試羊進行有效等位基因分析表明:在湖羊檢測到的有效等位基因數目最多，為5.5309。有19個位點的平均有效等位基因數目都超過4個.5.運用軟件，進行哈代一溫伯格平衡檢驗，我們得出幾乎所有的位點在7個綿羊品種中都處于哈代一溫伯格不平衡狀態(tài)，只有個別位點在個別品種中達到平衡，如BMC1206在晉中羊品種中，ILSTS021在哈薩克羊品種中基本達到平衡。6.中性測試結果表明:共有5個位點(MB009BM1341BM3033BMS64

5、44BM315)屬于中性位點。7‘對受試羊進行基因流分析，發(fā)現巴音布魯克羊和阿拉泰羊之間有較大的基困流(7.5731)荃因流相對最小的是黑藏羊和湖羊之間，其值為3.0964.8.F一統(tǒng)計量分析表明:各標記FST的變化范圍是從BMS875的0.0293到ILSTS021的0.3969，平均值為0.0747群體每代遷移數在0.3799(ILSTS021)和8.2854(BMS875)荊安III摘要GeneticDiversityStudyw

6、ithMicrosateliteDNAon7NativeSheepBreedsinChinaAbstractThegeneticdiversityof7nativesheepbreedsinChinawasanalyzedwiththemicrosatellitemarkertechnologybasedontherequirementofprojectassignment.Thesheepbreedswereasfollowings:

7、HusheepHasakesheepBayinbulukesheepAleitaisheepHeizangsheepBaizangsheepandJinsheep.Thethesisdiscussedthegeneticvariationwithinpopulationandamongpopulations.Theresultswerefollowed:1.The286allelesweretestedin28microsatellit

8、elociandeachlocushad10.6.Themostwas18inAGLA269thesecondwas15inBM4311.Theleastwas4inBM315andILSTS021.2.Theresultsshowedthat28locihadthehighlydominantallelesand11locihadprivatealleles.3.Themeanheterozygosityofdifferentlocu

9、svariedfrom0.0629to0.5903andofdiferentpopulationwasfrom0.3421to0.4215whichbelongedtomiddleheterozygositylocusandpopulation.ThePICvaluewerelessthan0.5inBM315ILSTS021theother26lociwerehighdiversity.In26locitherewere4lociwh

10、ichPICvaluevariedfrom0.60to0.7013lociwhichPICvaluewasfrom0.70to0.80andtheother9locisPICvaluevariedfrom0.80to0.90.ThePICvalueinAGLA269locuswasthehighestandinILSTS021locuswasthesmallestwhichvalueswere0.8712and0.3453each.Th

11、emostvaluewas0.7590inHusheepandtheleastwas0.7317inHasakesheep.4.TheHusheephadthemostefectivenumberofallelewhichwas5.5309.Theaverageefectivenumberofallelein19lociwasallmorethan4.5.AlmostallofthelociwerenotintheHDWequilibr

12、iumthroughthetestofHDWwithx2in7sheepbreedsexceptBMC1206locusintheJinzhongsheepandILSTS021locusintheHasakesheep.6.TheNeutralityTestshowedthat5loci(MB009BM1341BM3033BMS6444BM315)belongedtoneutralitylocus.7.Therewasthemajor