遼寧雜草稻的遺傳多樣性及群體分化研究.pdf

1、雜草稻又名雜草型稻或雜草種系,在美國又被稱作紅米(red rice),它廣泛分布于溫帶、熱帶地區(qū),甚至一些沒有野生稻存在的地區(qū),如美國、歐洲等地.雜草稻具有雜草的一些特性,存在于栽培稻田中影響水稻的產量和質量.中國作為世界上主要的稻作生產區(qū)之一,近年來由于直播與輕型栽培等技術的推廣,雜草稻的危害已日趨嚴重.遼寧作為中國的主要水稻產區(qū)之一也同樣存在著這樣的問題.該文通過對遼寧雜草稻的RAPD及SSR分析研究了遼寧雜草稻的遺傳多樣性及群體分

2、化情況,獲得了以下一些主要結論:1.所分析的20個隨機引物共擴增出了1 09條帶,但是只有引物S303、S4出現(xiàn)4個多態(tài)位點,多態(tài)性位點所占的比例(P)只有3.7％.遼寧雜草稻總體的等位基因觀察值(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、基因多樣性指數(shù)(h)、Shannon多樣性指數(shù)(I)分別為1.0370、1.0201、0.0111、0.0168.采用的21對SSR引物中只有10對引物能在40個遼寧雜草稻樣品中的擴增出多態(tài)的產物,多態(tài)位點所占

3、的比例約為47.62％,其Shannon多樣性指數(shù)(I)為0.2902、期望雜合度(He)為0.0393.與以往利用SSR及RAPD在研究水稻遺傳多樣性的結果相比,遼寧雜草稻基因多樣性很低.2.根據(jù)RAPD與SSR獲得的遼寧雜草稻的群體分化系數(shù)(Gst值)分別為0.8849和0.6660,表明遼寧雜草稻約有2/3的變異來自于群體間.RAPD結果的AMOVA分析顯示群體間變異占總變異的92.31％,特別是地區(qū)間的變異尤為明顯(占總變異的9

4、5.49％),地區(qū)間的分化達到了極顯著水平(P<0.001).分析的21個SSR位點中共有1 0個是多態(tài)位點,其中4個位點上(占40％)沈陽與丹東兩地的雜草稻有各自特異性的等位基因.這些均說明遼寧雜草稻各群體之間的分化程度較大,特別是丹東與沈陽兩地之間的分化更為明顯.SSR及RAPD兩種分子標記比較分析的結果表明,雖然這兩種分子標記在分析遼寧雜草稻遺傳多樣性及群體分化時得到了基本一致的結論,即多樣性較低但群體間分化特別是地區(qū)間分化較大.