稻種資源核心種質(zhì)研究及其信息處理系統(tǒng)骨架的建立.pdf

1、該研究從三個方面對核心種質(zhì)研究中存在的一些問題進(jìn)行了探討,包括核心種質(zhì)取樣研究,利用核心種質(zhì)進(jìn)行遺傳多樣性以及進(jìn)化演化研究;和建立核心種質(zhì)信息處理系統(tǒng)骨架的研究.主要研究內(nèi)容和結(jié)果如下:研究了不同數(shù)目和多態(tài)性的SSR位點所估算群體的遺傳結(jié)構(gòu),以及利用不同數(shù)目和多態(tài)性的SSR位點所構(gòu)建核心種質(zhì)的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性.結(jié)果表明,標(biāo)記的選擇與研究目的和對象有關(guān);評價遺傳多樣性和構(gòu)建核心種質(zhì)的效果不能簡單認(rèn)為和等位基因數(shù)有關(guān),實質(zhì)上是和位點數(shù)相

2、關(guān);要精確估計地方稻種的群體遺傳結(jié)構(gòu)以及選取一個有代表性的核心種質(zhì),就SSR位點來說,以隨機選擇18-24個為宜.利用模擬和抽自一個水稻核心種質(zhì)的兩套群體,研究了不同群體參數(shù)和取樣參數(shù)與變異保留比例的關(guān)系.通過這些參數(shù)對變異保留比例的相關(guān)和通徑分析發(fā)現(xiàn),在影響變異保留比例的取樣參數(shù)中,取樣量是決定性的因素.取樣量由欲保留的變異比例以及群體中稀有變異的情況而定.利用不同取樣途徑和取樣方法從由1527份材料組成的一個群體中得到53個備選核心

3、種質(zhì),通過比較其多樣性指數(shù)、變異和變幅保留比例、變異系數(shù)和方差,認(rèn)為逐級取樣有利于獲得較多的遺傳變異和去除遺傳重復(fù),而且對不同數(shù)據(jù)都具有好代表性.逐級取樣的一個優(yōu)點是,即便在開始取樣時沒有大量數(shù)據(jù)信息可利用的情況下,也可以通過逐級利用更加豐富的數(shù)據(jù)信息,最終獲得有代表性的核心種質(zhì).以云南地方稻種資源核心種質(zhì)為研究對象,利用20個SSR位點的數(shù)據(jù)研究了稻種資源的遺傳多樣性和分化情況.結(jié)果發(fā)現(xiàn),包括思茅、臨滄和西雙版納在內(nèi)的位于滇西南的三個

4、地區(qū)是云南地區(qū)稻的遺傳多樣性中心;在云南粳稻起源早于秈稻.通過比較核心種質(zhì)擴增多態(tài)性所表現(xiàn)出的遺傳多樣性和分化與分屬秈粳兩個亞種的三個材料在相同SSR位點上的DNA序列特征及分化發(fā)現(xiàn),亞種間的變異來自SSRs位點的重復(fù)區(qū),絕大多數(shù)是插入/缺失突變.秈稻內(nèi)的變異很大部分來自重復(fù)區(qū)的插入/缺失突變,也有相當(dāng)部分為轉(zhuǎn)換/顛抽.發(fā)生于SSRs位點的轉(zhuǎn)換/顛換變異會增加亞種間的遺傳分化,可能是由于轉(zhuǎn)換/顛換造成的變異對秈粳兩個亞種適應(yīng)性的影響不同