基于基因檢測比對(duì)的實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)設(shè)計(jì)研究

1、基于基因檢測比對(duì)的實(shí)驗(yàn)信息管理系統(tǒng)設(shè)計(jì)研究摘要實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS)將實(shí)驗(yàn)室的儀器設(shè)備、檢驗(yàn)各環(huán)節(jié)中涉及的人員和部門通過計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)連起來，采用科學(xué)的管理思想和先進(jìn)的數(shù)據(jù)庫技術(shù)，實(shí)現(xiàn)以實(shí)驗(yàn)室為核心的整體環(huán)境的全方位管理。目前，有許多單獨(dú)的實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS)單獨(dú)對(duì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行管理。但是，高效管理的LIMS系統(tǒng)能夠管理實(shí)驗(yàn)信息的仍然較少。為了滿足這些需要，我們?cè)O(shè)計(jì)了這個(gè)LIMS系統(tǒng)來嘗試更加高效的管理信息。本文中研究的系統(tǒng)集

2、樣品管理，資源管理，事務(wù)管理，質(zhì)量控制，網(wǎng)絡(luò)管理，數(shù)據(jù)管理圈∈集、傳輸、處理、輸出、發(fā)布)，報(bào)表管理等諸多模塊為一體，組成一套完整的實(shí)驗(yàn)室綜合管理和產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)控體系，是驗(yàn)室的軟件工作平臺(tái)。系統(tǒng)既能滿足日常檢驗(yàn)、數(shù)據(jù)分析和技術(shù)管理耍求，又能保證實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)庫建設(shè)的嚴(yán)格管理、控制。系統(tǒng)的開發(fā)主要是在實(shí)現(xiàn)基本用戶、系統(tǒng)等管理的同時(shí)，使用GeneMapper處理生成的數(shù)據(jù)表，以及使用EntityFramework抽象化數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的方式，將每個(gè)數(shù)據(jù)庫

3、對(duì)象都轉(zhuǎn)換成應(yīng)用程序?qū)ο?entity)，而數(shù)據(jù)字段都轉(zhuǎn)換為屬性(property)，關(guān)系則轉(zhuǎn)換為結(jié)合屬性(association)，方便了程序員等對(duì)數(shù)據(jù)庫的操作，實(shí)現(xiàn)基因的匹配計(jì)算，繪制出基因圖譜。實(shí)現(xiàn)從實(shí)驗(yàn)的委托到檢驗(yàn)再到分析結(jié)果的一系列操作，使實(shí)驗(yàn)步驟更加規(guī)范化，盡量避免人為失誤的產(chǎn)生，建立起一個(gè)犯罪DNA數(shù)據(jù)庫。關(guān)鍵字：LIMS、基因比對(duì)、EntityFramework、數(shù)據(jù)庫萬方數(shù)據(jù)基于基因檢測比對(duì)的實(shí)驗(yàn)信息管理系統(tǒng)設(shè)計(jì)研究目

4、錄摘要1ABSTRACT：2目錄3第一章緒論511課題的背景及意義5111課題背景5112課題意義612犯罪DNA數(shù)據(jù)庫實(shí)驗(yàn)室管理系統(tǒng)的應(yīng)用現(xiàn)狀713擬解決的關(guān)鍵問題814課題的研究方法、設(shè)計(jì)以及實(shí)驗(yàn)方案8第二章LIMS知識(shí)簡介921實(shí)驗(yàn)窒信息管理系統(tǒng)的基本概念922實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS)的發(fā)展歷史10221LIMS發(fā)展至今大體可分為以下幾個(gè)階段lO222LIMS發(fā)展歷程(以主要產(chǎn)品為代表)1023傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIM

5、S)的基本基本運(yùn)行環(huán)境以及系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)10231基本運(yùn)行環(huán)境10231系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)1124設(shè)計(jì)開發(fā)實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS)的目的11241規(guī)范實(shí)驗(yàn)室內(nèi)部管理一1124。2實(shí)現(xiàn)質(zhì)量數(shù)據(jù)大范圍共享1l2。5傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(uMS)的介紹12251管理模塊12252查詢統(tǒng)計(jì)模塊1226傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(uMs)的開放式架構(gòu)1327實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS)的系統(tǒng)設(shè)計(jì)原則，13271實(shí)驗(yàn)室網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)構(gòu)架一132。7，2

6、系統(tǒng)權(quán)限管理構(gòu)架一14273分析儀器設(shè)備的數(shù)據(jù)合理整合系統(tǒng)14274以分析測試工作為核心的網(wǎng)絡(luò)管理體系14275實(shí)驗(yàn)室其他管理信息體系模塊1428本章小結(jié)14第三章基于DNA項(xiàng)目的LIMS設(shè)計(jì)開發(fā)相關(guān)背景知識(shí)。1631背景知識(shí)16311ORM的選型16312EntityFramework與WCF的比較，17313EntityFramework與NHibemate的比較1732基因相似度匹配1833系統(tǒng)設(shè)計(jì)中的設(shè)計(jì)模式使用18331設(shè)計(jì)模