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文檔簡介
1、[目的]:探討中國華北地區(qū)人群抗原處理相關(guān)轉(zhuǎn)運(yùn)體基因1(transporterassociatedwithantigenprocessing1,TAP1)基因單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)與乙肝發(fā)生的關(guān)聯(lián)。 [方法]:提取中國華北地區(qū)176例乙肝患者及該地區(qū)208例健康獻(xiàn)血者外周血基因組DNA,用PCR方法擴(kuò)增TAP1基因包含Codon333、637這兩個多態(tài)性位點(diǎn)的片段,
2、采用DNA直接測序法檢測健康個體基因型,用限制性片段長度多態(tài)法(restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)明確乙肝患者基因型。并采用PHASE1.0軟件構(gòu)建這兩個多態(tài)性位點(diǎn)的個體單倍體型。以非條件Logistic回歸校正混雜因素,并進(jìn)行多態(tài)性與乙肝風(fēng)險關(guān)聯(lián)性的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。 [結(jié)果]:TAP1基因2個多態(tài)性位點(diǎn)在華北地區(qū)人群中具有多態(tài)性(均為A→G)。其中Codon637多態(tài)性位點(diǎn)在兩組
3、人群中的差異有高度顯著性(P<0.01),較之野生型A/A,雜合型A/GOR=4.68(95%CI=2.99-7.33),純合型G/GOR=6.34,(95%CI=2.49-16.13);Codon333多態(tài)性位點(diǎn)在兩組人群中無差異(P>0.05)。在這兩個位點(diǎn)所構(gòu)建的單倍體型中,我們研究發(fā)現(xiàn)含有AG單倍體的個體在兩組人群中具有高度差異(P<0.01),OR=19.85,(95%CI=8.33-47.31)。 [結(jié)論]:TAP1
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