東亞部分馬群體線粒體Cytb基因序列及分子系統(tǒng)學(xué)研究.pdf

1、本文通過對馬的線粒體細(xì)胞色素b(cytb)基因全序列的遺傳變異分析，來探討中國家馬8個(gè)群體、普氏野馬、韓國cheju馬和日本家馬之間的親緣關(guān)系和遺傳多樣性。 運(yùn)用分子生物學(xué)軟件分析本研究測定蒙古馬、普氏野馬A系和B系線粒體cytb基因全序列和從Genbank中獲得的9個(gè)群體37條序列，總共12個(gè)群體的DNA多態(tài)性，并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。Cytb基因序列變異分析表明：1)馬的cytb基因全序列長度一致為1，140bp，無插入和缺失；2

2、)Cytb全序列含52個(gè)核苷酸變異位點(diǎn)，33個(gè)簡約信息位點(diǎn)，其中處于密碼子第三位的變異最大，第一位和第二位堿基的變異相對較?。?)Cytb基因全序列中堿基組成富含A，T，A+T含量為54.6﹪，且第二位點(diǎn)A，T偏向性更加明顯，達(dá)到61.5﹪。所有群體在第三位點(diǎn)上堿基G的含量極少，平均僅為5.2﹪，且在種間表現(xiàn)出4.7﹪～5.5﹪的差異。Cytb基因在密碼子使用上具有明顯的偏向性。4)核苷酸轉(zhuǎn)換遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于顛換(轉(zhuǎn)換/顛換=14.2)，轉(zhuǎn)換主

3、要為C→T、T→C、A→G、G→A，顛換很少發(fā)生，堿基替換大都發(fā)生在密碼子第三位，基因序列中的轉(zhuǎn)換與顛換都未飽和；5)按照cytb蛋白結(jié)構(gòu)模型，cytb基因全序列可分為三個(gè)功能區(qū)，核苷酸變異多發(fā)生在跨膜區(qū)。Cytb基因的3'末端比5'末端攜帶有更多的系統(tǒng)學(xué)信息。對東亞的12個(gè)馬群體進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析，使用3種常用的建樹方法NJ法、UPGMA法和MP法，所構(gòu)建的分子樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本一致。分析表明：1)中國家馬具有多個(gè)起源或經(jīng)過多次馴化。2)