支持虛擬篩選的數(shù)據(jù)庫管理工具的研究與實現(xiàn).pdf

1、藥物設計是隨著藥物化學學科的誕生而相應出現(xiàn)的，主要應用于創(chuàng)新藥物先導化合物結構的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化。虛擬篩選是藥物設計方法的延伸和推廣，是創(chuàng)新藥物研究的新方法和新技術。虛擬篩選是指利用計算機強大的計算能力，采用三維藥效基團模型搜尋或分子對接的方法，在化合物數(shù)據(jù)庫中尋找可能的活性化合物。整個篩選過程需要用到配體分子往往有數(shù)百萬個。隨著計算科學和計算方法的不斷發(fā)展，以及計算機性能的不斷提高，虛擬篩選的計算速度也在不斷的提高。與此同時，在虛擬篩選速度

2、穩(wěn)步提高的情況下，化合物數(shù)據(jù)庫的訪問成了制約篩選速度的一個重要因素。所以設計一個支持大規(guī)模虛擬篩選的數(shù)據(jù)庫管理工具可以有效的提高藥物篩選的速度和效率。
　　 支持篩選的小分子數(shù)據(jù)庫所具有的數(shù)據(jù)量往往是巨大的，其分子數(shù)從幾十萬到上千萬不等。此外化合物數(shù)據(jù)庫存儲結構的復雜性也是造成數(shù)據(jù)量龐大的一個主要原因。而傳統(tǒng)的集中式數(shù)據(jù)處理方式因其可靠性不高，系統(tǒng)的可擴充性較差，勢必會成為整個系統(tǒng)的瓶頸。此時數(shù)據(jù)的分布式處理成為了一種必然。本文