深圳市HIV-1分子流行病學(xué)及不同亞型混合感染研究.pdf

1、[目的]
　　 人類免疫缺陷病毒Ⅰ型(human immunodeficiency virus Type1，HIV-1)屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒科慢病毒屬中的人類慢病毒，是獲得性免疫缺陷綜合征(AcquiredImmune Deficiency Syndrome，AIDS)的病原體。艾滋病在全球的廣泛流行，給人類造成了巨大的災(zāi)難。HIV-1是一種高度變異的病毒，有數(shù)十種不同的基因亞型，在一個感染者體內(nèi)的不同組織、甚至在同一個組織中不同病毒

2、顆粒均有基因組的變異，這些在同一個感染者體內(nèi)變異的病毒株構(gòu)成了HIV-1的準(zhǔn)種(quasispecies)。分子流行病學(xué)調(diào)查檢測到的HIV-1基因變異只是HIV-1在感染個體中的優(yōu)勢株的基因組差異，而準(zhǔn)種基因差異分析可以幫助我們更精細地了解HIV-1的變異規(guī)律，通過準(zhǔn)種分析可以發(fā)現(xiàn)HIV-1感染者體內(nèi)是否存在HIV-1不同亞型的混合感染狀況。我國在HIV-1準(zhǔn)種方面的研究較少，我們尚未發(fā)現(xiàn)國內(nèi)關(guān)于HIV-1不同亞型混合感染的報道。

3、>　　 [方法]
　　 本研究從HIV-1分子流行病學(xué)入手，采用巢式PCR擴增HIV-1基因組ENV區(qū)和GAG區(qū)基因片段，然后進行測序分析，建立進化樹模型，分析亞型分布的差異，分析HIV-1優(yōu)勢株、聚集性和傳播途徑的特點；采用有限稀釋法檢測HIV-1準(zhǔn)種，分析深圳HIV-1主要亞型的準(zhǔn)種變異特點；進而通過準(zhǔn)種分析發(fā)現(xiàn)HIV-1不同亞型混合感染者，分析混合感染者體內(nèi)不同亞型的HIV-1準(zhǔn)種的基因組特征。
　　 [結(jié)果]<

4、br>　　 (1)深圳市HIV-1分子流行病學(xué)分析：深圳市HIV-1所有傳播途徑中，性傳播占88.0％；所有亞型中，CRF01-AE占51.8％；在MSM人群中，CRF01-AE形成了3個簇；不同HIV亞型的同性傳播與異性傳播各自形成簇，部分傳播途徑內(nèi)夾雜有其他傳播途徑的序列；少數(shù)標(biāo)本測序出現(xiàn)重疊峰，env與gag的分型結(jié)果不一致。
　　 (2)HIV-1準(zhǔn)種分析及不同亞型混合感染分析：深圳市不同的HIV-1亞型均有準(zhǔn)種分布，

5、同一感染者體內(nèi)準(zhǔn)種的基因變異較不同感染者體內(nèi)的HIV-1毒株變異小。這反映了HIV-1感染的時間越長，感染者體內(nèi)準(zhǔn)種的基因變異越大。本次研究發(fā)現(xiàn)在混合感染的標(biāo)本中有6例標(biāo)本存在兩種或以上亞型混合感染，其它的則是同一亞型的準(zhǔn)種變化。
　　 [結(jié)論]
　　 深圳市HIV-1感染者以20～40歲的年輕人為主，性傳播是主要的傳播途徑；CRF01-AE是深圳HIV-1的主要流行株；在同性傳播中，CRF01-AE可能來源于三個毒株；