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文檔簡介
1、背景及目的:
宮頸癌(cervical cancer)是女性最常見的生殖道惡性腫瘤之一,在全球范圍內,每年約有20多萬女性死于宮頸癌,目前宮頸癌仍然是導致我國婦女死亡的主要原因之一,我國每年新發(fā)現131500個病例,且宮頸癌的發(fā)生率有上升和年輕化趨勢。
WAPL(wing-apart like)蛋白作為一種新的調控異染色體結構的基因產物,首先在果蠅體內被證實。研究表明人體內WAPL的同源基因產物hWAPL(h
2、umanwing-apart like)蛋白是一種凝集蛋白結合蛋白,它通過與凝集蛋白的調節(jié)亞基直接相互作用,使凝集蛋白在細胞分裂初期從染色體臂及時分離。hWAPL基因在宮頸癌中呈現高表達,并且hWAPL基因表達水平與宮頸病變程度呈正相關。
在人類疾病中,很多疾病是由基因變異導致的,單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotide polymorphism,SNP)是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性
3、,是人類基因組遺傳變異中最普遍的形式。其中,能代表其它位點信息的SNP位點稱為標簽SNP(tagSNP),少數幾個tagSNP就能夠提供該區(qū)域內大多數的遺傳多態(tài)模式,從而大大提高關聯分析的有效性,即通過較少的SNP位點達到更強的統(tǒng)計學效果。
目前,一些文獻都揭示了WAPL基因與宮頸癌之間存在著某種關聯性,然而關于WAPL基因上的SNP位點與宮頸癌之間的關聯性研究國內外尚未見有報道。本課題的目的是通過檢測hWAPL基因tag
4、SNP在漢族婦女宮頸癌患者的分布特點,篩查可能與宮頸癌發(fā)病相關的tagSNP位點,為進一步發(fā)現宮頸癌的發(fā)病原因及預防和治療提供線索。
材料和方法:
收集2008年8月至2009年10月河南省六家市級及省級醫(yī)院300例同期住院婦女的抗凝全血標本,病例組150例,血標本來自經常規(guī)病理確診的宮頸癌患者,患者采血前均未進行化療或放療,其中宮頸鱗狀細胞癌132例,宮頸腺癌18例,年齡23歲~67歲,平均年齡48歲;對照
5、組150例,血標本取自同期住院的宮頸正常的患者,其中子宮肌瘤129例,盆腔臟器脫垂21例,年齡27歲~78歲,平均年齡53歲。所有婦女均為漢族人。
應用離心柱型全血基因組DNA快速提取試劑盒提取300例含0.4%EDTAK2(乙二胺四乙酸二鉀)的抗凝全血的DNA。瓊脂糖凝膠電泳(SDS-AGE)技術及凝膠成像系統(tǒng)對提取的全血DNA進行檢測和質量控制。應用基質輔助激光解吸附電離飛行時間質譜(MALDI-TOF)檢測技術對選出
6、的hWAPL基因的12個tagSNPs位點進行檢測應用。應用SPSS15.0和Haploview4.2軟件統(tǒng)計對hWAPL基因基因型、等位基因型和單體型的數據進行統(tǒng)計分析,初步篩選與宮頸癌相關的hWAPL基因的tagSNPs位點。其中,基因型與等位基因型分布頻率用x2檢驗,同時計算OR值和95%可信區(qū)間(CI),所有檢驗均為雙側檢驗,檢驗水準α=0.05。
結果:
1本報告所涉及的所有SNP位點等位基因和基因
7、型的觀察值和期望值吻合良好,均符合Hardy-Weinberg平衡定律。
2病例組和對照組中,hWAPL基因的SNP位點rs11595882的危險等位基因位點T(0.163:0.073,x2=11.36,P=0.001,OR=2.481)、rs10887621的危險等位基因位點C(0.880:0.820,x2=4.235,P=0.040,OR=1.610)、rs11202058的危險等位基因位點G(0.800:0.730,
8、x2=4.088,P=0.043,OR=1.479),在病例組中的頻率明顯高于對照組。
3危險型基因型與非危險型基因型頻數比較,病例組與對照組等位基因型分布統(tǒng)計結果顯示:位點rs7083506的(CC+CT)/TT等位基因型(x2=6.522,P=0.011,OR=3.273,95%CI=1.261-8.493);rs11595882的(TT+TC)/CC等位基因型(x2=10.03,P=0.002,OR=2.510,95
9、%CI=1.406-4.482);rs7918136的(TT+TA)/AA等位基因型(x2=6.522,P=0.011,OR=3.273,95%CI=1.261-8.493);rs11202058的(GG+GA)/AA等位基因型(x2=6.522,P=0.011,OR=3.273,95%CI=1.261-8.493)。四個位點危險型在病例組中的分布頻率明顯高于對照組。
4根據12tag SNP位點在所檢測人群中的分布得到1
10、0種單體型,其中,單體型H8(CCCCACCTGTCG)、單體型H10(CCCCATCTGTCG)在病例組中的頻率均高于對照組,且都存在顯著差異(P<0.05)。
結論:
1、hWAPL基因的單核苷酸多態(tài)位點rs11595882 T、rs10887621 C、rs11202058G在宮頸癌患者中的分布存在明顯差異,說明hWAPL基因遺傳多態(tài)性與漢族婦女宮頸癌的發(fā)生有關,是宮頸癌發(fā)生的易感基因之一。
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