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文檔簡介
1、玉米(Zea mays L.)是重要的糧食、飼料和能源作物,提高產(chǎn)量一直是玉米育種的主要目標(biāo)。產(chǎn)量是穗長、穗粗、百粒重等諸多因素共同作用的結(jié)果,遺傳基礎(chǔ)復(fù)雜,解析產(chǎn)量相關(guān)性狀及其配合力的遺傳基礎(chǔ)對玉米育種具有重要意義。本研究以248份玉米自交系和400份F1為試驗材料,利用基于GBS技術(shù)獲得10,684個多態(tài)性SNP位點,通過兩年兩點試驗對玉米產(chǎn)量相關(guān)性狀及其配合力進行全基因關(guān)聯(lián)分析,挖掘顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點。主要研究結(jié)果如下:
2、 1.在自然群體和F1群體中,產(chǎn)量相關(guān)性狀都存在廣泛的表型變異。聯(lián)合方差分析表明,產(chǎn)量相關(guān)性狀及其配合力基因型間差異均極顯著,6個產(chǎn)量相關(guān)性狀的廣義遺傳率在59.67~80.28%,大小依次為粒長>穗長>百粒重>粒厚>穗粗>粒寬。產(chǎn)量相關(guān)性狀一般配合力的遺傳率在51.26~76.28%,大小依次為粒厚GCA>粒寬GCA>穗粗GCA>穗長GCA>粒長GCA>產(chǎn)量GCA。
2.四個環(huán)境下產(chǎn)量相關(guān)性狀共檢測到21個SNPs,表型貢
3、獻(xiàn)率在11.36~28.14%之間。在保定環(huán)境下檢測到5個SNPs,辛集環(huán)境下檢測到16個SNPs。粒長在四種環(huán)境下僅檢測到1個SNPs,分布在2號染色體上,解釋的表型變異為26.12%;粒厚檢測到6個SNPs,分布在chr2、chr3、chr4、chr5、chr6和chr7,其單個SNPs解釋的表型變異為11.36~28.14;檢測到控制粒寬的SNPs4個,分布在chr1、chr3和chr7,單個SNPs解釋的表型變異為16.11~2
4、6.32%;分別檢測到7個和3個SNPs與穗長和粒厚顯著關(guān)聯(lián)。共檢測到與產(chǎn)量相關(guān)性狀配合力有關(guān)的SNPs49個,單個SNPs解釋的表型變異變化范圍在9.26~21.25%之間。其中,與粒厚GCA顯著關(guān)聯(lián)的SNPs為35個,分布于1~10號染色體上,表型貢獻(xiàn)率的變化范圍為9.26~15.38%;穗粗GCA的關(guān)聯(lián)位點為37個,粒長GCA、粒寬GCA和穗長GCA分別檢測到了2、2和12個SNPs,單個SNPs解釋的表型變異范圍在11.25~1
5、7.26%。
3.利用各性狀的最優(yōu)線性無偏預(yù)測(BULP)值進行全基因組關(guān)聯(lián)分析,檢測到47個與產(chǎn)量相關(guān)性狀及其配合力顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點。
4.對比BLUP值和原始數(shù)據(jù)定位結(jié)果,找到9個一致性SNPs,且多次被檢測到,進一步挖掘候選基因,得到16個可能與產(chǎn)量性狀及其配合力相關(guān)的候選基因。
5.研究中未找到一般配合力和對應(yīng)的產(chǎn)量相關(guān)性狀一致的SNPs,表明一般配合力的遺傳基礎(chǔ)與其對應(yīng)產(chǎn)量性狀的遺傳基礎(chǔ)在一定
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